1.细胞通讯分解对于细胞数的要求是甚么？
答：每种细胞类别提议细胞数没有少于50个，假设是细胞数过少，大概找没有到咱们存眷的配体受体，大概是咱们存眷的记号通路。
2.细胞通讯分解只可分解配体受体嘛，一氧化氮这种记号有没有细胞通讯分解？
答：细胞通讯分解只可分解配体受体，一氧化氮这种是没有的，由于一氧化氮并没有是有mRNA编码的，所以单细胞测序检测没有到，然后配体受体也就没法分解。
3.辅导单细胞以及空间转录组毗连整合而今主流的是用甚么软件？
答：主流的是MIA和spotlight大概RCTD。
4.假设想找两个蛋白，是否生存配体受体联系能从单细胞测序数据找纪律吗？
答：单细胞测序看的是mRNA的表达水平，也许按照RNA去推想配体受体的表达，假设两个蛋白并没有是配体受体，那本来也是找没有到的。
5.假设做共病争论，是没有是也许将两个器官的数据贯串正在一统分解呢？
答：假设是把两个器官的数据全数放正在一统的话，那理论上做进去的配体受体并没有特定恐怕反应可靠状况。因而正在分组上我们也许思虑把两个器官分成两组，然后不同去较为两个器官，正在配体受体大概说细胞通讯上生存甚么分裂。
6.互作强度是一切联系的基因表达加以及吗？
答：互作强度正在cellchat里面是指的是一切细胞之间配体受体表达概率的累加值，不过分歧的分解方式所代表的道理大概没有一律。
7.良多细胞通讯方式应该怎样选呀？
答：是取决于教授想要取得甚么样的数据，比如cellchat里面也许做两组之间的较为，NicheNet也许看卑劣靶基因的一个改变等等；假设教授没有一定要求的话多个分解方式都是也许做的，咱们也许经过利用多种方式，然后再看哪种分解方式进去的数据了局较为好。
8.细胞通讯能预计左右游联系吗？
答：细胞通讯分解，也许做配体受体对于应的靶基因和卑劣记号通路，不过像上游的转录因子的改变，大概说卑劣的蛋白代谢物的改变，细胞通讯是没法分解的。
9.有没有植物范畴做细胞通讯分解？
答：今朝基于五个模式物种大度高相信度的配体受体互对峙的数据库以及软件包一经有文献宣布，公司正在测试是可行的，后续过程上线之后也许与出售或本领支柱共事施行磋商。
10.若何决定数据库中蕴含存眷的受配体联系对于？
答：咱们也许根据分解软件的官方网站去检察它的数据库实质，网站支柱挑选查找，也许去检察数据库中是否蕴含咱们存眷的受配体联系对于。也也许正在分解时提取并检察背景数据库实质。
11.做细胞通讯分解细胞类别有要求吗？例如就2类大概3类 。
答：对付细胞通讯收集判断分解来讲，对于细胞类别的几许没有全部要求，不过正在可视化时细胞类别较多大概会呈现难以区分的了局。就须要施行指定受配体联系对于大概细胞类别互对峙来施行可视化。
12.辅导若何领会通讯的weights或strength呢？
答：正在cellchat分解了局中，weights以及strength是用来量化细胞之间通讯强度，是根据细胞群正在每个受配体联系对于中的通讯概率施行汇总整合后失去的了局。
13.想问下多组较为是要怎样较为呢？是只可较为两个分组吗？
答：对付cellchat软件施行多组较为，本来是也许没有只限于两个分组，咱们也许建立多个cellchat工具的list集中,之掉队行mergeCellchat合并分解，经过指定我须要对于比的分组去施行可视化。
14. 细胞通讯数据库中有鸡的吗？没有的话用鼠类的去分解鸡，能发文章吗 ？
答：今朝动物的数据库物种大多为人以及小鼠这类模式物种，鸡、猴、猪等物种与人的基因同源性较高，是也许同源变换为人的基因之掉队行细胞通讯分解的。
15.细胞数过多怎样处置 ？
答：细胞数目过多时也许根据咱们的须要，针对于遴选某些细胞类别施行互作分解，大概根据每类细胞群的细胞数按比率施行降采样处置。
以上便是咱们对付诸君教授课题答疑的文字版，供专家参照，再次报答诸君教授的支柱。假设还有其他课题的话，也许关连您的出售提问，咱们也会给出回答。
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