正在往昔的一年多时光里，寰球肠道范畴争论连续呐喊大进，博得了颇多令人夺目的掘起。咱们基于《关切肠日报》中收录的2021年以后宣布的肠道范畴论文，施行了***度评选，变成了《关切肠日报》2022年度榜单。
2022年度榜单参评的文章公有3955篇，宣布正在441个分歧的期刊上，累计作用因子到达了70979.04，平衡作用因子17.95。个中来自Cell、Nature、Science的文章168篇，来自NEJM、Lancet、JAMA的文章68篇。
本榜单仅代表关切肠争论院基于自身数据所做的优选，大概生存客观因素困扰等没有足，仅供参照。本篇揭晓“年度130篇肠道争论论文”。
NEJM：高升糖指数食物推广心血管疾病以及短命告急
New England Journal of Medicine[IF:91.245]
① 纳入5个大洲的137851人（35-70岁），中位随访9.5年，评估膳食血糖天生指数（GI）以及血糖负荷（GL）与心血管疾病（CVD）及仙逝率的联系；② 高GI与主要心血职业件（心血管仙逝、非致去世性心肌梗去世、中风以及心衰）以及全因仙逝的告急上升相干（对于基线时患以及未患CVD的人，HR不同为1.51以及1.21），这种有关正在BMI≥25的人群中更分明；③ 对付基线时已患CVD的人，高GL也与主要心血职业件以及全因仙逝的告急上升相干。
Glycemic Index, Glycemic Load, and Cardiovascular Disease and Mortality
2021-02-24, doi: 10.1056/NEJMoa2007123
Gordon团队再发NEJM：靶向菌群改善孩子营养没有良
New England Journal of Medicine[IF:91.245]
① 118名12-18月龄的中度急性营养没有良孩子告竣一项随机比照考察，选择菌群导向性辅食（MDCF-2）或比照辅食（RUSF）干涉3个月，之后随访1个月；② 即使热量低于RUSF，MDCF-2对于孩子繁殖（身长别体重（WFL）以及春秋别体重的z评分）的改善动机却优于RUSF，且该动机持续至干涉停止后；③ 与RUSF比拟，MDCF-2更好的选拔了与WFL正相干的70种血浆蛋白（蕴含介导骨骼繁殖以及神经发育的蛋白）以及21个肠道细菌类群的水平。
A Microbiota-Directed Food Intervention for Undernourished Children
2021-04-07, doi: 10.1056/NEJMoa2023294
NEJM：谷氨酰胺转化酶2克制剂可无效减缓乳糜泻
New England Journal of Medicine[IF:91.245]
① 142名乳糜泻患者随机等分为4组，每日口服10mg、50mg、100mg的ZED1227或刺激剂，延续6周；② 一切剂量的ZED1227都可昭著减缓谷蛋白向导的十二指肠粘膜损害，比拟于刺激剂组，10mg、50mg、100mg剂量组比拟于基线时的绒毛高度/隐窝深度的比值改变的推广值不同为0.44、0.49及0.48；③ 比拟于刺激剂组，100mg剂量组比拟于基线时的上皮内淋巴细胞密度改变值昭著升高（升高值为-9.6/100个上皮细胞）；④ 100mg ZED1227可昭著改善糊口质量及病症。
A Randomized Trial of a Transglutaminase 2 Inhibitor for Celiac Disease
2021-07-01, doi: 10.1056/NEJMoa2032441
武阳丰+田懋一团队发NEJM：用钾盐代替全体钠盐，可削减心血职业件以及短命告急
New England Journal of Medicine[IF:91.245]
① 一项非盲、整群随机考察，纳入中国600个村子共20995名有中风史的患者或≥60岁的高血压患者，以村为单元1:1随机分为盐代替的干涉组（75%钠盐+25%钾盐）以及比照组（全钠盐），平衡随访4.74年；② 与比照组比拟，干涉组的中风、主要心血职业件以及全因仙逝的产生率都昭著升高，RR不同为0.86、0.87以及0.88；③ 安全性方面，高钾血症的产生率正在两组间无昭著分裂。
Effect of Salt Substitution on Cardiovascular Events and Death
2021-08-29, doi: 10.1056/NEJMoa2105675
NEJM：S1PR调治剂可无效改善溃疡性结肠炎
New England Journal of Medicine[IF:91.245]
① 645名UC患者随机分为2组，每日不同口服ozanimod或刺激剂，尚有367名UC患者每日口服ozanimod（非盲妄图）；② 干涉10周后，2个部队的ozanimod组中展现出临床应对的患者随机等为2组，不同口服ozanimod或刺激剂，而刺激剂组中展现出临床应对的患者延续口服刺激剂，延续至第52周；③ 正在向导期及减缓期，ozanimod组的临床减缓率（18.4% vs. 6.0%，37.0% vs. 18.5%）及临床应对率（47.8% vs. 25.9%，60.0% vs. 41.0%）均昭著高于刺激剂组。
Ozanimod as Induction and Maintenance Therapy for Ulcerative Colitis
2021-09-30, doi: 10.1056/NEJMoa2033617
NEJM：小心艰苦梭菌今天1早上习染复发，菌群药物SER-109无效！
New England Journal of Medicine[IF:91.245]
① 一项3期双盲随机比照考察，182名复发性艰苦梭菌习染患者分2组，正在通例抗生素调节后，服用菌群药物SER-109或刺激剂胶囊，延续3天；② 干涉后8周内，SER-109组的复发率昭著低于刺激剂组（12% vs 40%， RR 0.32），且正在分歧春秋段以及采用分歧品种抗生素的患者中均昭著升高复发告急；③ SER-109所含菌种可加紧、延续地正在患者中定植，且次级胆汁酸（克制艰苦梭菌孢子萌发）浓度正在SER-109组更高；④ 两组的没有良事宜如同，主假如轻中度胃肠道病症。
SER-109, an Oral Microbiome Therapy for Recurrent Clostridioides difficile Infection
01-20, doi: 10.1056/NEJMoa2106516
南边医科大学NEJM：少吃也许减肥，限没有限时作用没有大
New England Journal of Medicine[IF:91.245]
① 纳入139例瘦削患者，随机平衡分为八小时（8:00am-4:00pm）限时热量限制组以及没有限时热量限制组；② 干涉12个月后，与基线比拟，限时组以及没有限时组的平衡体重不同下降8、6.3公斤，但正在终点时的体重无组间分裂；③ 两种饮食办法带来的腰身、BMI、体魄脂肪、瘦体重、血压和代谢告急因素等了局与体重改变统一；④ 两组正在产生负面事宜数目上也无昭著分裂；⑤ 正在体重、体脂以及代谢告急因子方面，一段时光的限时热量限制的动机并没有优于没有限时热量掌握。
Calorie Restriction with or without Time-Restricted Eating in Weight Loss
04-21, doi: 10.1056/NEJMoa2114833
Lancet：Filgotinib可无效向导并维持溃疡性结肠炎的临床减缓
Lancet[IF:79.321]
① 纳入1348名中重度震动性溃疡性结肠炎患者施行向导调节，2:2:1分为3组，每日不同口服200mg或100mg的Filgotinib或刺激剂，延续11周；② 10周后，200mg组的临床减缓率昭著高于刺激剂组；③ 10周后到达临床减缓的患者连续施行维持调节，刺激剂组连续口服刺激剂，Filgotinib组2:1分为2组，不同口服向来剂量的Filgotinib或刺激剂；④ 58周后，200mg组及100mg的临床减缓率均昭著高于各自对于应的刺激剂组（37.2% vs. 11.2%，23.8% vs. 13.5%）。
Filgotinib as induction and maintenance therapy for ulcerative colitis (SELECTION): a phase 2b/3 double-blind, randomised, placebo-controlled trial
2021-06-03, doi: 10.1016/S0140-6736(21)00666-8
Lancet：减盐对于心衰患者有分明利益吗？
Lancet[IF:79.321]
① 将来自6个国家的806名成年耐性心力萎缩患者随机分为两组，397名摄取低钠饮食，409名施行通例照看；② 干涉12个月后，低钠饮食组的中位钠摄取量从2286毫克/天降至1658毫克/天，通例照看组从2119毫克/天降至2073毫克/天；③ 12个月干涉时期，低钠饮食组及通例调节组不同有60人（15%）及70人（17%）产生了主要了局的事宜（席卷心血管相干入院、心血管相干急诊救治、全因仙逝），无统计学分裂；④ 两组均未讲述安全性事宜。
Reduction of dietary sodium to less than 100 mmol in heart failure (SODIUM-HF): an international, open-label, randomised, controlled trial
04-02, doi: 10.1016/S0140-6736(22)00369-5
JAMA：鱼油以及维生素D并没有能小心房颤
JAMA[IF:56.272]
① 既往争论以为海洋Omega-3脂肪酸（EPA以及DHA）以及维生素D对于房颤发作既有利益，也有告急；② 经过进步2×2析因随机临床考察的协助争论，招募2.5万余名50岁以上美国住户施行干涉考察，并随访5年以上；③ 公有96.1%的受试者告竣考察，个中900名（3.6%）正在干涉以及随访历程中产生房颤发作；④ 干涉组与比照组房颤发作数目无昭著分裂，且未发明EPA-DHA以及维生素D间生存彼此影响；⑤ 两种补剂均没有能升高突发性心房震动的告急，所以没有提议算作主要防治目的。
Effect of Marine Omega-3 Fatty Acid and Vitamin D Supplementation on Incident Atrial Fibrillation A Randomized Clinical Trial
2021-03-16, doi: 10.1001/jama.2021.1489
JAMA：益生菌LGG没法小心危宿疾人呼吸机相干肺炎
JAMA[IF:56.272]
① 一项多焦点随机比照考察，2653名利用呼吸机的危宿疾人分2组，经肠内路子弥补鼠李糖乳杆菌GG（LGG）或刺激剂；② 益生菌组以及刺激剂组不同有21.9%以及21.3%的患者产生呼吸机相干肺炎，组间分裂没有昭著；③ 其他次要终点正在两组间也无昭著分裂（ICU取得性习染、泻肚、抗生素利用、仙逝率、入院时长等）；④ 两组不同有1.1%以及0.1%的患者产生没有良事宜（从血液等样本中结合出乳杆菌属细菌，普遍审定为LGG），提醒危宿疾人利用LGG有习染告急。
Effect of Probiotics on Incident Ventilator-Associated Pneumonia in Critically Ill Patients A Randomized Clinical Trial
2021-09-21, doi: 10.1001/jama.2021.13355
JAMA：1.8万人RCT露出弥补鱼油可否小心烦闷症
JAMA[IF:56.272]
① 分解VITAL-DEP争论中的18353名≥50岁受试者，基线时没有烦闷症以及临床相干烦闷病症，随机分2组，每天弥补鱼油（1克/天）或刺激剂；② 90.3%的受试者告竣考察，中位干涉时长5.3年；③ 干涉时期，鱼油组的烦闷症或临床相干烦闷病症的告急昭著高于刺激剂组（HR 1.13），但基于患者强健问卷烦闷量表的思绪评分正在两组间无昭著分裂；④ 没有良事宜正在两组间无昭著分裂；⑤ 该了局没有支柱用ω-3弥补剂小心烦闷症。
Effect of Long-term Supplementation With Marine Omega-3 Fatty Acids vs Placebo on Risk of Depression or Clinically Relevant Depressive Symptoms and on Change in Mood Scores: A Randomized Clinical Trial
2021-12-21, doi: 10.1001/jama.2021.21187
Nature子刊：利用GT-Pro加紧确切地对于人体肠道菌群施行宏基因分型
Nature Biotechnology[IF:54.908]
① 作家开垦了GT-Pro，利用高质量基因组，构建了 909 集体类肠道物种中 1.04 亿个 SNPs 的名目，并利用针对于该名目的特殊 k-mers 表征来自 7,459 个样本的肠道菌群的寰球种群组织；② GT-Pro 避免了算计老本高的短读长对于齐，并以更高的确切性施行宏基因分型，尤为是对付低揭开率物种；③ 正在办事器上利用 GT-Pro 施行大领域人类全基因组有关争论正在算计上是可行的，并且也许正在集体算计机上分解中等领域的部队。
Fast and accurate metagenotyping of the human gut microbiome with GT-Pro
王军+陈义华NBT攻破：用人工智能大领域开采人肠道菌群中的抗菌肽
Nature Biotechnology[IF:54.908]
① 贯串3种当然语言处置神经收集模子（LSTM、Attention以及BERT），建立一个从序列数据中开采抗微生物肽（AMP）的过程，确切率>90%；② 将该方式用于人肠道宏基因组数据，贯串宏蛋白质组数据过滤，和与肠菌的相干性收集分解，审定出241个候选AMP；③ 经过化学分解失去216个新式肽，阐明个中181个（83.8%）有抗菌影响，这些AMP与已知AMP同源性低；④ 进一步挑选出个中的强效AMP，能经过分歧体制无效克制多重耐药革兰氏阳性致病菌，并正在细菌性肺习染小鼠模子中验证了3种AMP的无效性。
Nature子刊：分解1000+人，审定菌群、饮食以及代谢的联系
Nature Medicine[IF:53.44]
① 肠道菌群与一定营养素、食物品种以及饮食模式等有昭著有关，强健植物性食物尤为塑造菌群组成，大度与饮食/强健相干的微生物尚待表征；② 审定出可正在其他部队中反复的瘦削相干菌群记号物；③ 粪便普氏菌以及芽囊原虫与较好的餐后糖代谢相干，大伙的菌群组成可预计一系列空腹以及餐后的心血管代谢记号物；④ 与饮食强健及心血管代谢强健相干的菌群物种生存大度重叠，一组含30种微生物的记号物可识别无病症个别的心血管代谢以及饮食的大伙强健利害。
Nature子刊：低脂高碳水vs高脂低碳水，两种饮食对于人体各有啥作用？
Nature Medicine[IF:53.44]
① 20名青年受试者按随机秩序施行低加工度的低脂高碳水的植物性饮食（LF）或高脂低碳水的动物性饮食（LC）干涉，每种延续2周，无洗改期，没有限进食量；② 受试者正在LF时期的每天能量摄取分明低于LC（出入约550~700千卡），但饥饿感、饱腹感、满意感等无分裂；③ LC以及LF都引起体重加重（LC更快更分明），但仅LF削减了体魄脂肪量，而LC则推广能量消费、匆匆进生酮并维持血糖以及胰岛素牢靠正在较低水平；④ 该了局与碳水化合物-胰岛素模子的预计没有统一。
Nature子刊：肠道细菌作用地中海饮食的“食疗”动机
Nature Medicine[IF:53.44]
① 纳入307名男性，对于菌群数据、永恒饮食信息、血样中的葡萄糖稳态、脂质代谢及炎症的生物记号物施行纵向分解；② 对于强健地中海饮食模式的允从性与肠道菌群的组成及功能（植物多糖降解、短链脂肪酸及次级胆汁酸天生、果胶代谢）相干；③ 地中海饮食对于心血管代谢强健的损坏影响因肠道菌群组成而异，地中海饮食与心血管代谢强健之间的损坏性有关正在Prevotella copri品貌较低的到场者中展现更强。
The gut microbiome modulates the protective association between a Mediterranean diet and cardiometabolic disease risk
Nature子刊：精巧改革酵母益生菌，克制肠道炎症
Nature Medicine[IF:53.44]
① 肠道菌群以及宿主免疫细胞孕育的胞外三磷酸腺苷（eATP）是一种匆匆炎代谢物，能激活嘌呤能记号，进而匆匆进炎症性肠病（IBD）；② 用定向进化以及分解基因回路本领，开垦一种基于酿酒酵母的工程益生菌；③ 该菌表达对于eATP敏锐的人P2Y2嘌呤能受体渐变体，当感到到eATP时，能煽动三磷酸腺苷双磷酸酶的表达以及渗出，以降解过多的eATP并孕育克制炎症的腺苷；④ 正在多种IBD小鼠模子中，这种工程酵母益生菌能克制肠道炎症，削减肠道纤维化以及菌群平衡。
Nature子刊：FMT+低发酵纤维，改善胰岛素敏锐性更无效？
Nature Medicine[IF:53.44]
① 61名重要瘦削以及代谢分析征患者告竣一项随机双盲比照考察，争论单次口服胶囊粪菌移植（FMT）后每天弥补多发酵性纤维（HF）或低发酵性纤维（LF）对于胰岛素敏锐性的作用；② 与FMT+HF、刺激剂+HF、刺激剂+LF比拟，FMT+LF组的胰岛素敏锐性目标HOMA2-IR正在干涉6周后失去昭著改善；③ FMT+LF干涉带来的代谢利益，与患者的肠内渗出反应的改善、肠道菌群丰硕度以及改革水准的推广和供体细菌植入的增加相关；④ 一切干涉的安全性以及耐受性优秀。
Nature子刊：肠道菌群或作用癌症免疫调节毒性
Nature Medicine[IF:53.44]
① 77例采用anti-CTLA-4以及anti-PD-1毗连免疫反省点阻断调节（CICB）的晚期黑色素瘤患者，拥有较高的>=3级免疫相干没有良事宜产生率（49%）；② 肿瘤相干的免疫以及基因组生物记号物对于CICB的反应与简单的免疫反省点阻断疗法如同，CICB的毒性与更各类化的外周T细胞库相关；③ 肠道菌群与CICB的反映拥有相干性；④ 产生毒性的患者肠道中拟杆菌的品貌昭著推广，且拟杆菌与患者肠道IL-1β以及结肠炎相关；⑤ 荷瘤小鼠中，肠道菌群经过IL-1β介导CICB向导的肠道毒性。
Nature子刊：露出全体IBD患者对于调节没有应对的体制
Nature Medicine[IF:53.44]
① 分解3个部队的376名IBD患者的转录组及病理学数据，审定出一些共表达基因模块，对于应分歧的病理学性格（病理型），与患者对于调节的应对相干；② 个中一种病理型的性格为深度溃疡部位的中性粒细胞高度浸润、成纤维细胞活化及上皮细胞丢掉；③ 活化的成纤维细胞展现出IL-1R（而非TNF）依附性的向导中性粒细胞趋化的性格；④ 正在4个独立部队（蕴含343名IBD患者）中，上述病理型相干的中性粒细胞及成纤维细胞性格正在对于多种疗法没有应对的患者中推广。
Nature子刊：肠道Akk菌品貌或可预计肺癌患者对于免疫调节的应对
Nature Medicine[IF:53.44]
① 纳入338名采用一线或二线ICI（PD-1/PD-L1单抗）的NSCLC患者；② 调节前的粪便菌群中可检测到Akk菌（Akk+）与主观应对率推广及总存在期缩短昭著相干，且没有依附于患者的PD-L1表达、抗生素利用及体力状态；③ Akk+与更丰硕的肠道共生菌群（席卷霍氏真杆菌及青春双比方杆菌）相干，并与炎性肿瘤微境况相干；④ 较低的Akk菌品貌与更长的总存在期相干，而较高的Akk菌品貌反而与更短的总存在期相干，抗生素利用与较高的Akk菌品貌相干。
Nature子刊：靶向肠-脑轴的“坏”菌群代谢物，有望改善自闭症
Nature Medicine[IF:53.44]
① 小鼠争论说明，口服AB-2004（馨香族以及酚类小分子的吸附剂）能无效升高血液中的肠道菌群相干代谢产品4EPS，小心其引起的焦躁样动作；② 纳入30名有消化道病症的自闭症青少年，施行8周剂量逐渐推广的AB-2004口服干涉，阐明其安全性以及耐受性优秀；③ AB-2004昭著升高了受试者尿液以及血液中的4EPS等肠道菌群相干代谢物；④ 其余，受试者的当中ASD动作失去改善，并削减了胃肠道和焦躁以及易怒病症，同时也削减了与焦躁相干的大脑连贯。
Nature子刊：从代谢闭塞到心血管疾病，菌群以及代谢组产生了甚么改变
Nature Medicine[IF:53.44]
① 纳入1241名中年欧洲人，席卷强健人、无IHD的代谢闭塞者（瘦削/糖尿病）以及3个分歧临床阶段的IHD患者，涵盖IHD的整体疾病谱系，分解肠道菌群以及代谢组性格；② 保养药物以及糊口办法的作用后，用于识别IHD与强健人的菌群以及代谢组性格中，约75%也生存于代谢闭塞者中，提醒这些改变的呈现大概远早于IHD临床病发；③ 审定出4个类别的菌群以及代谢组性格（代谢闭塞相干、IHD特有、随疾病掘起而强化或削弱）；④ 与传统的告急记号物比拟，一定的IHD菌群以及代谢组性格能更好地将IHD与强健人或代谢闭塞者做识别。
Nature子刊：代谢组+微生物组，露出心血管疾病的个别化告急因素
Nature Medicine[IF:53.44]
① 纳入199名ACS患者以及970名比照，审定出ACS特殊的代谢组以及肠道菌群性格；② ACS中533种血清代谢物产生改革，水平升高的占大普遍且多与菌群以及饮食相关；③ ACS肠道菌群中某种梭菌科细菌耗竭，其与多个CAD相干代谢物的水平相干，大概对于CAD起损坏影响；④ 患者的代谢极度及其潜伏确定因素有个别分裂，且与临床性格以及了局相干；⑤ 与菌群以及饮食相关的ACS代谢极度也生存于有代谢闭塞的比照者中，但水准较轻，大概到场了CAD前的早期代谢闭塞；⑥ 基于代谢组的BMI预计模子用于ACS患者时，其预计值常高于理论值，且差值与糖尿病以及CAD重要水准相干。
Nature子刊：溃疡性结肠炎患者的B细胞反应重要平衡
Nature Medicine[IF:53.44]
① 纳入三组UC患者（原始部队、验证部队1以及2不同有145、664、143例），施行单细胞测序（RNA/IgH基因）以及蛋白质水平验证；② 发明UC患者肠道黏膜B细胞区室重塑：幼小B细胞以及IgG+浆细胞扩增，各类性、体细胞渐变削减以及幼稚度升高；③ 从炎症UC患者肠道结合出抗αvβ6整合素的自身反应性浆细胞；④ 肠道CXCL13+TPH细胞亚群扩增与致病性B细胞反应及肠道炎症相干；⑤ 肠道体液免疫的改变也表示正在轮回中，即与UC震动性以及并发症告急相干的β7+PB/PC扩增。
Nature子刊：肠道菌群与免疫反省点克制剂的临床反应相干
Nature Medicine[IF:53.44]
① 纳入5个查看部队共165例晚期皮肤黑色素瘤患者，网络免疫反省点阻断调节（ICI）结束前的粪便样本，施行宏基因组测序；② 将测序了局与以前宣布的147个宏基因组样本施行整合，发明肠道微生物组与ICI的反映相干，消失部队相干性；③ 呆板练习分解阐明微生物组与ICI的总体应对率以及无掘起存在率之间的关连，同时也露出了基于微生物组的性格正在分歧部队中的反复性有限；④ 审定出一组与ICI应对相干的物种，但没有一个物种可算作通用的生物符号物。
Cross-cohort gut microbiome associations with immune checkpoint inhibitor response in advanced melanoma
Nature子刊：丁酸梭菌可增强免疫反省点克制剂对于肾细胞癌的疗效
Nature Medicine[IF:53.44]
① 29名未经调节的转化性肾细胞癌患者随机分组，正在采用纳武单抗+伊匹单抗调节的同时，个中19名患者每日口服CBM588；② 干涉12周后，比拟于比照组，CBM588组患者的肠道菌群中的双比方杆菌属品貌未昭著推广，但CBM588组应对患者的双比方杆菌属品貌昭著推广；③ 比拟于比照组，CBM588组患者的无掘起存在期昭著缩短（12.7个月 vs. 2.5个月），主观应对率非昭著地上升（58% vs. 20%）；④ 两组之间的3级及4级没有良事宜产生率无昭著分裂（50% vs. 52%）。
Nature子刊：肠道菌群可作用黑色素瘤患者对于PD-1单抗调节的应对
Nature Medicine[IF:53.44]
① 纳入94名采用PD-1单抗调节的黑色素瘤患者；② 调节前（而非调节4个月后）的肠道菌群组成与调节一年后的临床了局相干；③ 将新部队与已宣布的4个部队的数据施行集合分解，放线菌门、毛螺菌科/瘤胃球菌科与较好的临床应对相干，而革兰氏阳性菌与炎症肠道基因性格、血液中性粒细胞/淋巴细胞比值上升及较差的临床应对相干；④ 毛螺菌科富集与较好的临床应对相干，链球菌属富集与较差的临床应对相干，而二者的富集均与免疫相干没有良事宜相干。
Nature子刊：肠道菌群或作用CAR-T的疗效及安全性
Nature Medicine[IF:53.44]
① 纳入228名采用CAR-T细胞调节的患者（137名NHL、91名ALL），约60%正在调节前利用过抗生素；② 调节前4周内的抗生素调节与较短的总存在期及较高的神经毒性告急相干；③ 正在蕴含48名患者的前瞻性部队中，患者调节前的粪便菌群与强健比照有昭著分裂；④ 患者调节前的粪便菌群中的一定细菌分类群及代谢通路与临床了局相干，更高的瘤胃球菌属、拟杆菌属及粪杆菌属的品貌与调节100破晓的全面应对相干。
Nature：肠道菌群“锻炼”的免疫细胞，帮忙大脑抗炎症
Nature[IF:49.962]
① 正在小鼠中审定出一类星形胶质细胞，表达溶酶体蛋白LAMP1以及仙逝受体配体TRAIL；② 这类细胞经过TRAIL-DR5记号向导效应T细胞凋亡，进而限制大脑炎症；③ 正在炎病症态下，T细胞以及小胶质细胞孕育的匆匆炎细胞因子，会克制星形胶质细胞表达TRAIL；④ 正在稳态状态下，脑膜处的当然杀伤（NK）细胞孕育IFNγ，能启动星形胶质细胞表达TRAIL；⑤ 肠道菌群激活NK细胞表达IFNγ，这些IFNγ+ NK细胞迁徙至脑膜向导孕育抗炎的星形胶质细胞。
Nature：一吃一定食物就腹痛？大概是肠道免疫细胞“搞错了”
Nature[IF:49.962]
① 小鼠中，肠道细菌习染或显露于超级抗原（如细菌毒素），会冲破对于时期进食的食物抗原的耐受性，引发肠道个别免疫应对，孕育食物抗原尤其的IgE抗体，激活瘦小细胞；② 之后再进食该食物抗原时，会引发由IgE以及瘦小细胞介导的腹痛，陪同肠道通透性推广；③ 该历程中，瘦小细胞释放的组胺影响于内脏传沉迷经上的组胺H1受体使其致敏，进而孕育腹痛；④ 如同的，向IBS患者的直肠乙状结肠黏膜注射食物抗原，会引起个别水肿以及瘦小细胞活化。
Nature：小肠类器官或能用于调节短肠分析征
Nature[IF:49.962]
① 正在小鼠以及大鼠中，经过移植回肠类器官，用小肠上皮庖代结肠上皮，能变成“小肠化”结肠（SIC）；② SIC有正确的小肠上皮组织，席卷肠绒毛、血管以及神经安排，和乳糜管（小肠特有的接收脂肪的淋巴管组织）；③ 体外以及体内测验再现，SIC变成绒毛组织须要延续的机器力（肠腔内的肠液震动）算作启发记号；④ SIC（正在回盲肠接壤处移植回肠类器官）能改善短肠分析征大鼠的肠萎缩、削减仙逝率，而移植结肠类器官则没有改善影响。
An organoid-based organ-repurposing approach to treat short bowel syndrome
2021-02-24, doi: 10.1038/s41586-021-03247-2
Nature：微生物之间的彼此影响若何启动早产儿肠道菌群的演变？
Nature[IF:49.962]
① 用MK-SpikeSeq方式测量早产儿的肠道细菌、真菌以及古菌的一致品貌的动静改变；② 肠道细菌群的演变是可预计的，以4个劣势菌属的演替改变为性格，而真菌群的改变难以预计，细菌以及真菌的载量呈负相干；③ 微生物之间（细菌之间、细菌-真菌之间）直接的、情境相干（体内大概与体外分歧）的互作，启动了菌群的改变；④ 如：“以后者”克雷伯菌能经过盘剥“先锋菌”葡萄球菌正在肠道中定植，而真菌白色念珠菌能克制克雷伯菌以及埃希氏菌等劣势细菌。
Nature：上交医学院团队审定损坏肠干细胞、抵挡肠炎损害的新式肠间质细胞
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① 激酶MAP3K2正在DSS向导的小鼠结肠炎中起损坏影响；② 审定出受MAP3K2调控正在肠损害后上调WNT振奋剂R-spondin1天生的一类肠间质细胞亚群（MRISC），有特殊的表不雅遗传以及转录组性格；③ MRISC位于结肠隐窝基底，经过上调R-spondin1天生，发扬维持LGR5+肠道干细胞（ISC）、抵当DSS向导的结肠炎的损坏性影响；④ MRISC经过ROS-MAP3K2-ERK5-KLF2通路上调R-spondin1表达；⑤ 所以，MRISC是ISC微境况中的枢纽组分，以依附于MAP3K2的办法增强WNT记号，匆匆进肠损害后的更生。
Nature：靶向gp130或可用于抗TNF调节有效的克罗恩病
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① 照顾NOD2功能缺失渐变的克罗恩病患者中，活化成纤维细胞及炎症巨噬细胞中的WT1及STAT3等上游转录因子富集，以上调NOD2弊端相干的匆匆炎及匆匆纤维化因子；② 缺失NOD2的CD14+ PBMC可孕育更多的胶原高表达细胞；③ 抗TNF调节没有应对患者的IL-11、OSM、IL-6等gp130家族基因表达上升；④ 正在斑马鱼中，NOD2缺失导致如同的髓系细胞-基质细胞活化表型，gp130克制剂减缓DSS向导的肠道炎症，并升高白细胞浸润及WT1等的表达（正在NOD2缺失个别中更为分明）。
Nature：小肠T细胞若何耐受高浓度的胆汁酸？
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① 小肠固有层的CD4+效应T细胞（Teff）中，核受体CAR（由Nrli3基因编码）调控异生物质转运体MDR1（匆匆进胆汁酸解毒以及克制小肠炎症）的表达；② CAR作用小肠（而非结肠）固有层Teff的转录法式，上调胆汁酸解毒相干的酶以及转运体的表达（一致其正在肝细胞中的影响），并匆匆进表达枢纽抗炎细胞因子IL-10；③ 正在胆汁酸启动的回肠炎小鼠模子中，CAR弊端型Teff会加剧炎症，而用药物激活CAR有抗炎动机；④ 所以，小肠Teff中CAR匆匆进解毒胆汁酸、加重炎症。
Nature：艰苦梭菌“盘剥”宿主炎症反应中孕育的代谢物
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① 正在小鼠肠道中定植野生型艰苦梭菌（Cd）以及没有产毒素的渐变型Cd，个中野生型Cd引发更重要的炎症，陪同Cd的山梨醇代谢路子上调；② Cd经过上调该路子来运用源自饮食以及宿主孕育的山梨醇算作养分，当山梨醇空洞时，Cd的毒素表达上升；③ 宿主经过醛糖恢复酶将葡萄糖转化为山梨醇，该酶正在多种肠道免疫细胞中表达，且正在Cd习染等引发的炎症时期表达上调，到场宿主抗习染免疫应对；④ Cd孕育毒素引发宿主炎症，进而向导宿主天生更多山梨醇来为Cd所用。
Nature：氨基酸摄取没有足时，菌群-肠-脑轴若何“精确”调治食欲？
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① 氨基酸摄取没有足时，果蝇肠细胞中的神经肽CNMamide（CNMa）表达上升，经过影响于神经元上的CNMa受体，孕育对于必须氨基酸（EAA）的代偿性食欲；② 这种食欲调控影响受共生菌群调治：定植产EAA的菌群可升高果蝇对于EAA的食欲，而定植没有产亮氨酸或其他EAA的渐变菌群，会推广果蝇的CNMa表达以及对于EAA的食欲；③ 所以，肠细胞能感知饮食以及菌群起因的EAA水平，经过上调CNMa的表达水平将EAA缺失的信息传播至大脑，进而调控果蝇对于EAA的代偿性食欲。
Nature揭秘：距今千年的前人肠道里有啥微生物？
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① 对于遗失齐备的8个古粪便样本（距今1-2千年）以及789个今生人（席卷工业化以及非工业化人群）粪便样本施行分解；② 前人的肠道菌群组成与非工业化人群更像；③ 基于古粪便构建了181个可托度较高的肠道微生物基因组，并进一步变成158个菌种基因组（SGB），个中39%的SGB是全新的；④ 运用组装变成的基因组，对于史小姐甲烷菌施行tip dating分解，露出了大概的进化史乘；⑤ 前人肠道菌群的抗性基因以及黏蛋白降解基因品貌较低，但富集可迁徙遗传元件。
Nature：胸腺中的菌群尤其性T细胞的孕育及影响
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① 断奶（而非成年）时代正在小鼠体内定殖分节丝状菌或大肠杆菌后，胸腺中的菌群尤其性CD4+ T细胞扩增，且正在胸腺中可检测到菌群DNA；② 体制上，CX3CR1+ 树突细胞可招揽肠道中的共生菌群抗原，并迁徙至胸腺中将抗原呈递给CD4+ T细胞，进而介导胸腺中的菌群尤其性T细胞的扩增；③ 胸腺中的菌群尤其性T细胞可迁徙至外周发扬功能，既大概推广菌群尤其性Th17细胞的肠道浸润以好转肠道炎症，又大概正在沙门氏菌习染中起到损坏性影响。
Nature：Apc渐变细胞若何取得合作劣势，进而起始肠癌？
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① Apc渐变细胞中，编码渗出型WNT拮抗因子的多个基因的表达上升，尤为是Notum；② 来自Apc渐变细胞的条件教育基能经过NOTUM依附的办法，克制野生型类器官繁殖；③ 渗出NOTUM的Apc渐变克隆能积极克制范围野生型隐窝细胞的增殖并启动其崩溃，进而正在细胞间的合作中胜出；④ 经过遗传或药物办法克制NOTUM，能正在小鼠中克制Apc渐变细胞的扩展以及肠道腺瘤的变成；⑤ NOTUM可算作小心Apc渐变型结直肠癌的靶点。
Nature：肠癌起始历程中，Apc渐变细胞若何战胜一般细胞？
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① Apc-/-肠道类器官能强力克制野生型肠道类器官的繁殖；② Apc-/-类器官经过渗出WNT拮抗因子（Notum、Wif1、Dkk2等）向导临近的野生型类器官产生崩溃并削减其肠干细胞（ISC），来取得合作劣势；③ 氯化锂（GSK3β克制剂）经过对于WNT通路的卑劣激活影响，使野生型ISC对于WNT拮抗因子变得没有敏锐，进而微小Apc-/- ISC的合作劣势；④ 正在Apc渐变小鼠模子中，小心性利用氯化锂可克制肠道中的Apc渐变克隆的扩展，削减腺瘤数目。
Nature：致癌基因若何重构干细胞巢匆匆肠癌？
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① 构建一种致癌基因相干的多色讲述小鼠模子，能对于统一构造中的渐变以及野生型细胞施行分裂性示踪；② 用该模子发明，表达Kras或Pik3ca致癌渐变的肠隐窝，可改革自身以及临近的一般隐窝的细胞组构（匆匆进干细胞崩溃、削减干细胞数目），加快克隆漂浮；③ 体制上，渐变隐窝可改革自身以及临近的干细胞巢的记号境况，使BMP记号增强，而表达Pik3ca渐变的隐窝还能经过改革临近基质细胞的基因表达来微小WNT记号境况。
Nature：Gordon团队妄图菌群导向性纤维零食
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① 正在定植瘦削者菌群+高脂低果蔬饲喂的悉生小鼠中，弥补分歧的果蔬纤维制剂引起了肠道菌群的纤维尤其性应对，席卷代谢通路、CAZyme以及一定菌种品貌（尤为是拟杆菌）的改变；② 选择高脂低果蔬饮食的瘦削/超重者，用含1种、2种或4种纤维的零食施行干涉，其菌群对于纤维零食的应对模式与悉生小鼠有很大如同，4种纤维的零食引起至多的CAZyme改变；③ 受试者菌群中CAZyme对于分歧纤维零食的应对，与反应生理状态改革的血浆蛋白质组的改变相干。
Nature：节食减肥，与菌群的定植抗性升高相关？
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① 超重/瘦削受试者施行极低热量饮食干涉后，无效加重了体重并改善血糖调控，陪同肠道菌群产生昭著而可逆的改变（细菌定植量升高、菌群组织以及代谢才略改革）；② 移植受试者干涉后的肠道菌群能使小鼠加重体重、改善糖稳态，这与饮食热量接收受损和艰苦梭菌的富集及其毒素表达相关（但没有引起分明的肠炎）；③ 饮食干涉削弱了菌群对于艰苦梭菌的定植抵当，这与粪便中的胆汁酸（席卷能克制艰苦梭菌的脱氧胆酸以及石胆酸）水平升高相关。
Nature：露出“肠道菌群-脑-动作轴”新体制！
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① 无菌小鼠以及抗生素处置（ABX）小鼠的外交震动削减，外交互动后多个脑区神经震动推广；② 该弊端是由外交互动后HPA轴孕育的应激激素皮质酮的极度上升而至，克制皮质酮分解、拮抗糖皮质激素受体或正在一定脑区敲除该受体，可矫正菌群耗竭引起的外交闭塞；③ 下丘脑室旁核中的CRH神经元调治小鼠外交动作，其失活可恶化ABX小鼠的外交闭塞，而其激活可使菌群一般小鼠呈现外交闭塞；④ 粪肠球菌可匆匆进小鼠外交震动，并克制外交后的皮质酮水平上升。
Nature：乙酸调控对于共生细菌的肠道IgA反应
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① 给小鼠弥补膳食乙酸，没有仅推广结束肠中的IgA天生，还改革了IgA库与一定共生菌的反应性；② 乙酸能启发对于一定共生菌的挑选性IgA反应，如增强SIgA对于大肠杆菌的反应性，并向导IgA库的相映改变，但没有作用对于多形拟杆菌的反应性；③ 乙明天2下午酸的这种影响能作用结肠黏膜菌群的组成，削减大肠杆菌的黏膜定植；④ 体制上，乙酸和好肠上皮以及免疫细胞间的互作，以依附于TLR记号的办法来增强由大肠杆菌向导的CD4 T细胞，匆匆进T细胞依附性的IgA天生。
Nature：肠道符合性免疫“驯化”致病真菌，匆匆进宿主-真菌共生
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① 正在人以及小鼠中，多种念珠菌都能向导尤其性的肠道IgA应对；② 白色念珠菌向导的IgA抗体，主要靶向并克制其有黏附影响的致病性菌丝，菌丝上富含的粘附素是IgA的直接靶点；③ 这种靶向菌丝的免疫挑选影响，进步了白念珠菌正在小鼠肠道内的合作适性；④ 这种免疫应对对于宿主也有益：白色念珠菌菌丝及其粘附素Als1能好转小鼠的肠炎损害，而用疫苗向导孕育粘附素尤其性的肠道免疫应对，能加重白色念珠菌相干肠损害。
Nature：解密肠道菌群代谢物的新器械
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① 开垦一个聚焦肠道菌群的代谢组学分解管线，用含833个代谢物的文库分解了178株常见人肠道细菌正在体外教育下的代谢谱；② 细菌的系统产生以及代谢才略之间生存错误应的联系，即系统产生上凑近的细菌之间大概有很大的代谢分裂，反之亦然；③ 发明了拟杆菌属的一种新代谢体制，能运用谷氨酰胺或天冬酰胺算作仅有氮源，并露出了其大概的代谢通路；④ 用单或多菌株定植小鼠肠道，能正在粪便以及血/尿液等样本中检测到对于应菌株的全体代谢物。
Nature：肠道若何作用感觉？
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① 肠道致病菌习染可引起果蝇脑部触角叶的鞘神经胶质细胞（EG）代谢重编程，进而调治感觉；② 体制上，习染向导肠细胞天生的炎症细胞因子Upd2以及Upd3能激活EG的JAK-STAT记号通路，进而向导EG表达单羧酸转运蛋白Out以及载脂蛋白Glaz，改革EG以及神经元的代谢偶联；③ 这会克制果蝇的感觉鉴识力，匆匆进其回避含致病菌的食物，推广存在；④ 这种作用正在年老果蝇中是永远的，而脆弱相干肠道炎症会引起耐性的EG代谢重编程，进而匆匆进了末年果蝇的感觉蜕化。
Nature聚焦百岁老人肠道菌群：一组寻常的胆汁酸或滋长寿
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① 百岁老人有特殊的肠道菌群性格，陪同粪便胆汁酸（BA）谱的改革，如初级BA升高、一组石胆酸（LCA）衍生物被富集；② 对于一位百岁老人的粪便细菌施行结合教育，审定出能孕育这些LCA衍生物的菌株（来自拟杆菌目）；③ 个中，Odoribacteraceae的多个菌株正在体内外均能孕育isoalloLCA，且依附于5α-恢复酶以及3β-羟基类固醇脱氢酶；④ isoalloLCA能强力克制艰苦梭菌等革兰氏阴性致病菌，提醒其大概有助于削减致病共生菌习染，进而匆匆进维持肠道稳态。
Nature：细菌若何运用仙逝的肠细胞“上位”？
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① 沙门氏菌等肠杆菌科细菌能运用由凋亡的肠细胞释放的营养身分，来匆匆进细菌自身繁殖以及正在小鼠肠道内的定植；② 这些营养身分是＜3kDa的可溶性小分子/代谢物，席卷丙酮酸以及依附于膜通道Panx1释放的代谢物等；③ 体制上，这些身分能向导沙门氏菌的转录应对，上调编码丙酮酸甲酸裂解酶的pflB基因表达，启动沙门氏菌的繁殖以及定植；④ 肠上皮细胞凋亡可使小鼠易感外源性沙门氏菌习染，也可匆匆进内源性肠杆菌科细菌的适度繁殖。
Nature：高果糖饮食若何“改革”肠道匆匆瘦削？
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① 小鼠中，膳食果糖能匆匆进小肠上皮细胞存在，引起肠绒毛变长，使肠道皮相积增大、对于脂质等的接收才略增强，进而加剧高脂饮食向导的瘦削；② 果糖投入肠细胞后被己酮糖激酶（KHK）转化为果糖-1-磷酸（F1P），F1P能克制丙酮酸激酶M2异构体（PKM2）活性（使高活性的PKM2四聚体分化为低活性的单体），进而经过上调HIF-1α来增强肠细胞以及肠癌细胞正在缺氧状态下的存在力；③ 敲除KHK或用药物TEPP-46激活PKM2，能克制由高果糖玉米糖浆引起的小鼠肠绒毛变长、脂质接收增加以及肠道肿瘤繁殖。
Nature：人肠道细胞的时空图谱
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① 分解胎儿、孩子以及成人的多个肠段以及肠系膜淋勾串的42.8万个细胞，绘制强健人肠道细胞谱；② BEST4肠细胞正在分歧肠段有分歧的基因表达性格， 利用分歧的功能；③ 簇细胞表达IgG受体基因FCGR2A，或有免疫感到功能；④ 形容了肠神经系统发育中的分歧神经细胞群，露出了资质性巨结肠（一种肠神经发育疾病）相干基因正在分歧细胞中的表达状况；⑤ 审定出正在早期发育中启动次级淋巴构造变成的枢纽细胞群，这一发育法式大概正在克罗恩病中重现并匆匆进炎症。
Cells of the human intestinal tract mapped across space and time
2021-09-08, doi: 10.1038/s41586-021-03852-1
Nature重磅：肠道细菌“吃”药，作用药物动机
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① 经过体外单菌教育分解25株肠道细菌对于15种药物的耗竭影响；② 审定出29种新的细菌-药物互作，个中17种归为生物积存影响，即细菌将药物储藏正在自身内而错误其施行化学化装，且大多没有作用细菌繁殖；③ 以度洛西汀为例分解分子体制，发明该药能与细菌的多种代谢酶贯串，进而正在细菌内积存并改革细菌代谢产品渗出；④ 体外菌群教育阐明，度洛西汀作用细菌间的代谢互养，进而改革群落组成；⑤ 线虫中，生物积存性细菌能削弱度洛西汀对于宿主动作的作用。
Nature：契合日夜节律的限时进食若何匆匆进强健短命？
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① 一种间歇性限时进食（iTRF）方式（隔天施行“过午没有食”式的20小时禁食），能正在果蝇中抗脆弱（推延肌肉以及肠道的脆弱记号物表达）、缩短寿命；② iTRF能增强日夜节律性的生物钟以及自噬基因表达，且其影响也依附于这二者；③ 敲除当中生物钟基因或克制自噬介导因子表达，和改为日间禁食/夜间进食或正在日间向导自噬，均使iTRF作废；④ 增强夜间的自噬，能正在草草进食的果蝇中起到与iTRF一律的有益影响，是iTRF抗脆弱、匆匆短命的主要体制。
Nature：肠道细菌经过一种硫酸酯酶降解结肠黏蛋白
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① 多形拟杆菌能运用硫酸化的结肠黏蛋白O-聚糖算作仅有碳源；② 对于该菌编码的12种硫酸酯酶施行底物尤其性分解，发明这些酶能移除O-聚糖上一切已知位置的硫酸基团；③ 剖析了个中3种3S-Gal硫酸酯酶的晶体组织，露出了其底物尤其性的组织根底；④ 对于多形拟杆菌的硫酸酯酶施行逐个以及配合式敲除，发明个中一种酶（BT1636^3S-Gal）是运用硫酸化的黏蛋白O-聚糖所必须的，正在该菌的肠道定植中起主要影响。
Nature：肠道渗出型IgA若何调治肠菌？
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① 用单菌株永远定植无菌小鼠肠道，可加紧挑选渗出IgA的肠道浆细胞，孕育一系列抗原尤其性的二聚体单克隆IgA（mIgA），主要靶向细菌皮相以及非皮相的膜抗原；② 构建小鼠模子争论单个mIgA对于肠道细菌的调控影响；③ 发明靶向分歧抗原的mIgA主要经过与抗原的尤其性贯串，对于细菌的功能以及代谢施加分歧作用；④ 靶向不异抗原的IgA对于细菌的作用也可因IgA表位尤其性而异；⑤ 而IgA对于细菌皮相的包被影响，常常能削减细菌静止以及帮忙细菌抵挡胆汁酸毒性。
Nature：抗生素捣毁无辜肠菌，一定解毒剂或能损坏
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① 分解144种抗生素对于38种代表性人肠道细菌的作用，发明分歧的抗生素有分歧的克制谱；② 喹诺酮类对于肠菌的攻击面随药物换代进级而扩张，β-内酰胺类的作用则有菌株尤其性；③ 而被以为是广谱抑菌剂的大环内酯类以及四环素类，正在精深克制共生菌的同时，挑选性地杀去世了一些菌种/株，进而能分明作用肠道菌群的组成；④ 挑选出多少“解毒剂”药物，能拮抗大环内酯类以及四环素类抗生素对于拟杆菌的误伤，并正在人粪便以及小鼠中确认了其对于拟杆菌的损坏影响。
Nature：肠神经胶质细胞正在肠道免疫以及构造建设中相关键影响
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① 正在肠道寄生虫习染的小鼠中，肠神经胶质细胞（EGC）产生增生，且其IFNγ靶基因上调，正在IBD患者中也有一致征象；② 阻断IFNγ-EGC记号（敲除EGC的IFNγ受体），可作用寄生虫习染后的小鼠肠道免疫稳态、迟延构造损害建设（肉芽肿消退），陪同肠肌层构造的匆匆炎转录法式活化，和卑劣的IFNγ靶基因表达克制；③ 体制上，IFNγ向导EGC上调趋化因子CXCL10的表达，全体介导了IFNγ-EGC记号对于寄生虫习染后的肠道免疫以及构造建设的调控影响。
Nature：低升糖饮食改革脂代谢，作用肿瘤繁殖
Nature[IF:49.962]
① 正在小鼠肿瘤模子中，热量限制（CR）能克制肿瘤繁殖，而生酮饮食（KD）没有能，这与CR（而非KD）升高血液以及肿瘤中的脂质水平相关；② 正在脂质耗尽的境况中，癌细胞的增殖依附于硬脂酰辅酶A去饱以及酶（SCD），该酶将饱以及脂肪酸（SFA）转化为单没有饱以及脂肪酸（MUFA）；③ CR以及KD都克制肿瘤的SCD活性，但CR引起一定MUFA/SFA比率失衡（升高），而KD维持MUFA/SFA比率，进而对于肿瘤繁殖形成分裂性作用；④ 改革CR以及KD中的脂质类别，能改革其对于肿瘤的作用。
Nature：棕榈油若何匆匆进癌症转化
Nature[IF:49.962]
① 膳食棕榈酸（PA）可匆匆进小鼠癌症转化，而油酸或亚油酸没有能；② 近期高棕榈油驯养，或永远显露于PA，足以使癌细胞孕育匆匆转化“记忆”，植入饮食一般的小鼠后仍有强转化性；③ 这种记忆依附于癌细胞的脂肪酸转运体CD36，且与甲基转化酶Set1介导的H3K4me3表不雅遗传的牢靠改变相关；④ 该表不雅遗传改变主要作用肿瘤的神经相干基因表达，由转录因子EGR2介导；⑤ 癌细胞孕育的神经肽甘丙肽可刺激肿瘤内的施旺细胞渗出一定的胞外基质，进而匆匆癌转化。
Nature：懦弱拟杆菌运用膳食氨基酸孕育调控宿主免疫的代谢物
Nature[IF:49.962]
① 懦弱拟杆菌（Bf）孕育的α-半乳糖神经酰胺类分子（BfaGC）有分歧的二氢鞘氨醇链以及脂肪酰链组织，作用其免疫调治效应；② Bf从宿主肠道中招揽膳食支链氨基酸，将其整合进BfaGC分子，变成BfaGC的末尾分支组织；③ 没有能代谢支链氨基酸的Bf渐变株孕育的BfaGC支链削减，正在小鼠体内可作用对于结肠NKT细胞的调控；④ 含支链（而非直链）二氢鞘氨醇的BfaGC能激活NKT细胞（如向导IL-2高表达）；⑤ BfaGC可算作配体被CD1d呈递，既而被NKT细胞受体判别。
Nature：小脑是克制食欲的枢纽
Nature[IF:49.962]
① 对于遗传性多食症患者以及小鼠的分解发明，外侧小脑深部核团DCN神经元对于食物做出反应；② DCN前部外侧亚核aDCN-Lat神经元的激活削减小鼠的进食，且没有导致积累性进食效应；③ 激活aDCN-Lat区域表达Spp1,Miat以及Crhr1的I类谷氨酸能神经元也许昭著克制动物食物招揽；④ aDCN-Lat神经元的激活克制小丘脑弓状核饥饿敏锐的AgRP营养神经元；⑤ aDCN-Lat神经元的激活进步腹侧纹状体多巴胺根底水平，进而克制VTA-DA神经元的敏锐性，克制食物招揽。
Nature：阿卡波糖降糖没有巴望？有菌群酶让药失活
Nature[IF:49.962]
① 搜寻人宏基因组数据+生化测试，审定出多个菌群编码的阿卡波糖激酶（Mak）基因；② Mak基因精深生存于口腔菌群，肠道菌群中也有一些；③ 对于个中一种酶Mak1做酶能源学以及晶体组织分解，发明该酶经过与已知阿卡波糖激酶AcbK如同的体制，尤其性地使阿卡波糖磷酸化，致其失活；④ 表达Mak1的工程菌能抵当阿卡波糖对于其繁殖的克制影响；⑤ 分解已宣布RCT数据发明，菌群中生存Mak基因的糖尿病患者对于阿卡波糖的调节应对较弱；⑥ 一种口腔放线菌可孕育内源性阿卡波糖样分子，或能注释何以Mak基因正在人微生物组中集体生存。
Nature：药物对于肠道菌群的作用比设想的要大
Nature[IF:49.962]
① 提出一个用于多组学横断面争论的分解框架，来分化疾病以及药物各自与肠道菌群及宿主性格的有关；② 分解欧洲心脏代谢疾病部队的2173人数据，说明药物对于宿主以及菌群性格的注释力大于疾病的注释力；③ 分解28种药物，露出了单个药物与宿主（表型、代谢组）以及菌群间的大度新有关；④ 对于药物配合的分解再现，多药的合资效应可将宿主代谢组以及菌群转向更强健的状态；⑤ 分解药物的累加效应再现，抗生素疗程数与菌群的“没有强健”状态生存定量联系；⑥ 还露出了药物剂量与临床记号物以及菌群间的联系，支柱药物的直接效应。
Nature：戒烟后何以易长胖？肠道菌群正在暗暗捣鬼
Nature[IF:49.962]
① 正在分歧饮食以及品系的小鼠中，抽烟克制体重增添，而戒烟引起体重加紧增添（SCWG）；② 抽烟导致小鼠肠道菌群组成以及功能改革，启动了SCWG，用抗生素耗竭菌群可克制SCWG，而移植抽烟/戒烟小鼠的菌群可使没有抽烟小鼠适度增重；③ 7种代谢物与菌群向导的SCWG相干，席卷DMG以及ACG；④ 菌群以及宿主代谢膳食胆碱孕育的DMG正在抽烟/戒烟的小鼠中天生增加，匆匆进肠道能量接收以及体重增添，而ACG则与DMG相反；⑤ 正在一袖珍部队中，抽烟者肠道菌群改革、DMG上升。
Nature：限制膳食缬氨酸，或为调节白血病供给新思路
Nature[IF:49.962]
① T-ALL中，缬氨酸tRNA表达上调，插入或缺失渐变则导致T-ALL细胞符合性升高；② 缬氨酸氨酰tRNA分解酶的表达由T-ALL中的枢纽癌基因NOTCH1转录上调；③ 经过饮食限制缬氨酸的生物运用度，损坏小鼠体内的这种平定，进而升高白血病负担，进步存活率；④ 缬氨酸限制升高编码线粒体复合物I亚单元mRNA的翻译率，导致复合物I组装弊端以及氧化磷酸化受损；⑤ SLC7A5、BCL2等基因敲除或药理学克制与缬氨酸限制拥有合资影响，升高T-ALL繁殖。
Nature：喝水解渴，肠道若何给大脑发记号？
Nature[IF:49.962]
① 向小鼠肠道注水引起的肠道低渗出压，可激活肠-脑路子中的迷走神经（而非背根神经节）的一定神经亚群；② 肝门区（HPA）是传播渗出压记号的主要区域，阻断安排该区域的迷走神经分支可清除迷走神经对于肠道低渗的反应；③ 经过小鼠动作测验以及对于大脑口渴神经元震动的纪录说明，源自HPA的渗出压记号对付饮水后的口渴清除是必需的；④ 该记号由血管活性肠肽（VIP，一种激素）介导，小鼠饮水后，VIP被渗出到门静脉，进而激活HPA的迷走神经。
Nature：进食依然求偶？一种肠道激素告知大脑若何挑选
Nature[IF:49.962]
① 雄果蝇正在饥饿时会优先辈食而非求偶，但招揽高蛋白食物后这一优先秩序正在多少分钟内仓卒恶化；② 肠-脑轴中的利尿激素31（Dh31，一种神经肽激素）记号启动了这种动作变换；③ 膳食氨基酸加紧激活果蝇肠道中表达Dh31的肠内渗出细胞，其释放的Dh31经轮回系统，激活大脑中表达Dh31受体（Dh31R）的神经元；④ 果蝇大脑中生存2种分歧的表达Dh31R的神经元群，不同经过释放神经肽AstC以及Crz来克制进食以及匆匆进求偶。
Nature：一种肠道菌群代谢物可作用大脑震动、匆匆焦躁
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① 审定出肠道菌群中将膳食酪氨酸转化为4-乙基苯酚（4EP）的生物分解基因，并构建孕育4EP的工程肠菌；② 用产4EP菌定植小鼠（4EP+），其宿主衍生物4EPS能投入大脑，使大脑震动以及功能连贯产生区域尤其性改革；③ 4EPS作用了小鼠大脑中的少突胶质细胞的功能，妨碍其幼稚，并削减其与神经元的互作；④ 4EP+小鼠展现入迷经元轴突的髓鞘化削减，焦躁样动作推广，而匆匆进少突胶质细胞崩溃幼稚的药物可避让4EPS对于小鼠动作的作用。
Nature：匆匆肠癌的细菌毒素可引爆其他肠菌内的“未必时炸弹”
Nature[IF:49.962]
① 一定细菌孕育的基因毒素colibactin可引起肠道菌群组成的精深改革；② 这种影响并非源于直接克制细菌繁殖，而是经过引起细菌的DNA损害反应，来激活细菌内的原噬菌体，引起噬菌体复制，导致细菌裂解；③ 正在人体及肠道相干的多种噬菌体-细菌系统中，和小鼠粪便菌群中，都查看到产colibactin细菌向导原噬菌体的影响；④ 正在多种没有孕育colibactin的细菌中审定出抗colibactin的ClbS的同系物，能帮忙细菌抵当colibactin。
Nature：真菌对于肠道炎症的菌株尤其性作用
Nature[IF:49.962]
① UC患者的结肠黏膜中，白色念珠菌（Ca）分明增加；② 对于结合菌的分解说明，人肠道Ca拥有高菌株各类性，其对于免疫细胞的损坏力和正在小鼠肠道中向导TH17以及匆匆炎免疫的才略拥有菌株尤其性；③ 体制上，高损坏力的Ca菌株经过渗出多肽毒素candidalysin（受Efg1-Ece1调控）匆匆进肠道炎症，且该影响依附于IL-1β，阻断其受体IL-1R可正在小鼠中加重疾病；④ 患者的Ca菌株向导免疫细胞损害以及IL-1β表达的才略，而非念珠菌属的品貌，可反应患者疾病水准。
Nature：人肠道细菌的胆汁酸代谢物可调治TH17，或可作用IBD
Nature[IF:49.962]
① 经过体外教育挑选，审定出可将石胆酸（LCA，一种次级胆汁酸）转化为3-oxoLCA并进一步转化为isoLCA的人肠道细菌及细菌酶（3α-羟基类固醇脱氢酶（HSDH）以及3β-HSDH）；② 与3-oxoLCA一致，isoLCA也经过贯串并克制RORγt的转录活性来削减TH17细胞崩溃，给小鼠定植产这2种代谢物的肠菌可升高TH17细胞水平；③ 正在炎症性肠病患者中，这2种代谢物及其生物分解所需的3α-HSDH基因的水平昭著升高，这些代谢物还与TH17细胞相干基因的表达负相干。
傅静远等Nature：人类肠道微生物组、显露组与遗传力
Nature[IF:49.962]
① 纳入来自3代人、2756个家庭的8208名荷兰人，分解其肠道微生物组成、功能、抗生素耐药性以及毒力因子等数据；② 区别出1253个微生物分类单元、564条代谢通路，约600个菌种、9个当中菌种和基石性格（28个菌种、53条通路），发明Prevotella copri主导微生物组分型；③ 分解241个宿主表型与微生物组间联系，露出了菌群与饮食、童年糊口境况、社会经济职位等显露组参数间7519个昭著有关；④ 发明同居是作用菌群的主要因素，只要6.6%的菌群如Akk菌可遗传；⑤ 分歧疾病拥有独特微生物组性格且与共存病无关，没有强健肠道菌群同时反应疾病以及用药状况。
Nature：生酮饮食或能克制大肠癌？体制是甚么？
Nature[IF:49.962]
① 正在结直肠癌（CRC）模子小鼠中，生酮饮食能无效克制肿瘤的产生繁华，进步永恒存在；② 生酮饮食经过进步其效应代谢物——酮体β-羟基丁酸（BHB）来发扬削减结肠隐窝细胞增殖、克制肠道肿瘤繁殖的影响，弥补BHB有异样动机；③ 体制上，BHB经过影响于细胞皮相受体Hcar2，向导有潜伏抑癌影响的转录因子Hopx表达，进而克制细胞增殖；④ 人肠道类器官以及CRC患者样天职析说明，BHB或能正在人肠道上皮细胞中上升HOPX水平并减缓细胞增殖。
黄路生院士+陈从英等Nature：首次露出作用肠道微生物组的宿主因果基因渐变
Nature[IF:49.962]
① 对于两个世代（F6以及F7）1500头测验猪施行全基因组重测序，测量>200个表型，并分解其出身后25、120及240天，回肠、盲肠以及粪便的菌群组成；② 发明统一个别分歧发育阶段及肠道部位菌群组成拥有昭著分裂；③ 正在F6以及F7中不同审定出1050以及955个细菌分类可遗传，遗传力最高达0.598（YRC22属），个中450个被反复验证；④ 审定到1527个昭著作用846个细菌分类的宿主基因组变异位点；⑤ 发明并验证家猪ABO血型基因中一个350万年前的2.3kb缺失会升高肠道N-乙酰半乳糖胺浓度，直接作用丹毒丝菌科营养代谢，使其品貌下降。
Science：粪菌移植可帮忙黑色素瘤患者应对抗PD-1调节
Science[IF:47.728]
① 15名PD-1难治性黑色素瘤患者，采用源自应对者的单次FMT毗连抗PD-1调节，有6名临床获益（3名减缓、3名病情牢靠），安全性优秀；② 毗连调节引起受体菌群加紧、长久的扰动，应对者的菌群变得更趋近于供体，长双比方杆菌、普氏粪杆菌等与调节应对相干的细菌类群增加；③ 应对者中，免疫克制性的IL-8+ 髓系细胞削减、肿瘤内CD8+ T细胞活化增加，血液细胞因子/趋化因子/代谢组分明改革；④ 跨界收集分解说明菌群正在多组学改变中有当中影响。
Fecal microbiota transplant overcomes resistance to anti–PD-1 therapy in melanoma patients
2021-02-05, doi: 10.1126/science.abf3363
Science：致病菌与肠道免疫之间的“斗智斗勇”
Science[IF:47.728]
① 鼠柠檬酸杆菌（Cr）有31种T3SS效应因子，对于其逐个叠加敲除，失去>100种渐变配合；② 小鼠习染测验说明，这些效应因子独特变成强力的收集，该收集可正在缩减60%的状况下（敲除19个因子）仍维持致病性；③ 分歧的效应因子收集引起分歧的结肠免疫应对，但都能向导宿主孕育能抵挡之后习染的损坏性免疫；④ 用呆板练习模子能预计分歧收集的定植了局；⑤ 表达人致病大肠杆菌效应因子库的Cr没法正在小鼠中定植，提醒效应因子收集拥有对于宿主的符合性。
Type III secretion system effectors form robust and flexible intracellular virulence networks
2021-03-12, doi: 10.1126/science.abc9531
Science：一种食源性酵母可妨碍肠损害愈合
Science[IF:47.728]
① 正在肠道损害的模子小鼠中，广谱抗生素处置会导致真菌正在黏膜损害处适度繁殖，妨碍其愈合；② 正在模子小鼠以及克罗恩病患者肠构造样本中，经过教育以及非教育方式发明，汉森德巴利酵母（Dh）正在未愈合/发炎的肠黏膜损害处尤其性富集；③ 将结合出的Dh引入到多种肠道损害-建设的模子小鼠中，均会克制肠构造建设，并能从伤口处再次结合出Dh，说明Dh满意科赫法律，是妨碍肠构造愈合的真凶；④ 体制上，Dh经过巨噬细胞的1型困扰素-CCL5轴来妨碍黏膜愈合。
Debaryomyces is enriched in Crohn’s disease intestinal tissue and impairs healing in mice
2021-03-12, doi: 10.1126/science.abd0919
Science：免疫细胞何如掌握肠道的营养接收？
Science[IF:47.728]
① 小鼠的小肠上皮能反映膳食碳水化合物，根据其可用度“按需”向导消化接收碳水化合物所需酶以及转运蛋白的转录法式，陪同肠上皮的重塑（改革分歧肠细胞亚群的比率）；② 这种“按需”的转录法式调控须要肠上皮与淋巴细胞间的互作回路，肠道γδ T细胞正在个中起主要介导影响；③ 体制上，高碳水饮食可改革γδ T细胞的肠隐窝定位以及转录组，γδ T细胞经过克制3型自然淋巴细胞天生IL-22，调控肠上皮的碳水化合物相干转录法式。
γδ T cells regulate the intestinal response to nutrient sensing
2021-03-19, doi: 10.1126/science.aba8310
Science：野灵便物肠道菌群——有待深切开采的宝库
Science[IF:47.728]
① 分解逾越180种野灵便物的肠道菌群，触及了分歧类型、摄食动作、地理区域以及性格的动物；② 基于宏基因组组装，构建了一个蕴含5000多个微生物基因组的数据库，并对于其分类以及功能施行解释，审定出1209种细菌，个中75%是未知的；③ 菌群的组成、各类性以及功能，与动物的品种、饮食、震动、社会组织以及寿命生存有关；④ 从食腐动物中审定出能代谢毒素的新的微生物基因，提醒野灵便物肠道菌群正在调节以及生物本领的研发方面有主要开采潜力。
Diversity and functional landscapes in the microbiota of animals in the wild
2021-03-26, doi: 10.1126/science.abb5352
Science：一种新发明的杯状细胞，对于肠道黏液屏蔽的变成相当主要
Science[IF:47.728]
① 小鼠肠道杯状细胞（GC）根据基因表达谱可分为多种亚群（结肠8种、小肠9种），GC崩溃幼稚的轨迹可归为2条；② 结肠的隐窝间GC（icGC）与隐窝内GC渗出的黏液都能拦阻细菌巨细的颗粒，但前者能禁止小分子经过（大概利于营养接收），后者则很是致密（损坏干细胞巢），二者独特变成黏液屏蔽；③ icGC弊端型小鼠的结肠黏液屏蔽齐全性受损，对于结肠炎更易感；④ 活检样天职析说明，溃结患者的GC脱落增加、icGC削减，陪同结肠黏液屏蔽弊端。
An intercrypt subpopulation of goblet cells is essential for colonic mucus barrier function
2021-04-16, doi: 10.1126/science.abb1590
Science：争论狒狒14年，覆盖被低估的肠道菌群遗传力
Science[IF:47.728]
① 对于585只野生狒狒14年间的16234个肠道菌群样本施行纵向分解，发明宿主对于肠道菌群的遗传效应多少乎是集体生存的；② 掌握饮食、春秋以及社会生态学变量后，97%的菌群性状（93%的分类群以及7个群落表型）消失特定水准的昭著遗传力，席卷正在人类中报道过的多个可遗传的菌群表型；③ 菌群性状的遗传力数值常常较低，但受宿主以及境况因素调控（如正在雨季、低食物各类性以及高龄宿主中上升）；④ 横断面分解以及小样本量会大大低估菌群性状的遗传力数值。
Gut microbiome heritability is nearly universal but environmentally contingent
2021-07-09, doi: 10.1126/science.aba5483
Science：肠源高密度脂蛋白若何损坏肝脏？
Science[IF:47.728]
① 小鼠小肠天生的HDL以HDL3亚型的大局与脂多糖贯串蛋白（LBP）变成复合体，直接投入门静脉从肠向肝输送；② 这些HDL3-LBP复合体能无效螯合血液中的脂多糖（LPS），进而阻断其贯串以及激活TLR4+ 肝脏巨噬细胞，同时没有作用酰基羧酸水解酶对于LPS的降解息争毒；③ 肠源HDL正在手术、高脂饮食以及喝酒等小鼠模子中被阐明有保肝影响，能削减LPS向导的肝脏损害；④ 肠道LXR（HDL分解相干基因的主要调控因子）振奋剂可进步肠源HDL水平，损坏小鼠肝脏。
Enterically derived high-density lipoprotein restrains liver injury through the portal vein
2021-07-23, doi: 10.1126/science.abe6729
Science：单菌水平的菌群空间转录组成像
Science[IF:47.728]
① 开垦细菌转录组成像方式par-seqFISH，能正在单菌水平上纪录细菌正在浮游以及生物膜大局下的基因表达以及生理参数；② 用该方式分解绿脓假单胞菌（Pa）正在分歧繁殖条件下的105个基因的转录谱；③ 露出了Pa正在浮游繁殖历程中的代谢及毒力相干细胞状态的动静改变；④ 还露出了Pa生物膜中的基因空间表达模式以及有分歧生理活性的细菌亚群，如鞭毛以及IV型菌毛基因表达互斥、绿脓菌素生存个别向导并正在细菌两极表达，氧气鼓鼓可用度塑造了生物膜中的细菌代谢异质性。
Spatial transcriptomics of planktonic and sessile bacterial populations at single-cell resolution
2021-08-13, doi: 10.1126/science.abi4882
Science：高脂饮食匆匆肠道微生物产TMA的新体制
Science[IF:47.728]
① 小鼠测验说明高脂饮食会引起肠道黏膜炎症，并导致上皮细胞线粒体活性下降，进而形成呼吸链电子受体（氧气鼓鼓以及硝酸盐）的推广，且上述作用没有依附于肠道菌群；② 氧气鼓鼓以及硝酸盐的推广为大肠杆菌供给了繁殖劣势，并匆匆进其cutC基因（到场胆碱转化为TMA的历程）的表达，以帮忙其运用胆碱算作碳源施行繁殖；③ 大肠杆菌对于胆碱分化代谢的强化会导致小鼠血液中TMAO水平的推广；④ 运用药物进步线粒体活性，可升高高脂饮食小鼠的TMAO水平。
High-fat diet–induced colonocyte dysfunction escalates microbiota-derived trimethylamine N-oxide
2021-08-13, doi: 10.1126/science.aba3683
Science：孕期母体习染若何作用后世的肠道免疫？
Science[IF:47.728]
① 用假结核耶尔森菌（YopM）永远习染孕鼠，厥后代小鼠成年后呈现肠道尤其性的Th17细胞数目增加、对于菌群的反应性增强；② 这种对于后世肠道免疫的永恒作用没有依附于母体菌群，而是由匆匆炎细胞因子IL-6正在宫内介导的：习染使母体IL-6上升，IL-6影响于胎儿肠上皮干细胞，推广其染色质封闭性并改革卑劣细胞功能（如推广抗原呈递分子以及抗菌肽的表达）；③ 孕鼠习染YopM或注射IL-6，可使厥后代对于肠道致病菌习染的抗性增强，但同时对于肠道炎症也更易感。
Prenatal maternal infection promotes tissue-specific immunity and inflammation in offspring
2021-08-27, doi: 10.1126/science.abf3002
Science：一定肠球菌若何增强癌症免疫调节？
Science[IF:47.728]
① 一定肠球菌属细菌（如屎肠球菌）能改善肿瘤小鼠对于anti-PD-L1免疫反省点克制剂（ICI）调节的应对；② 这些肠球菌表达并渗出肽聚糖水解酶SagA的同源物，能重构细菌胞壁肽聚糖身分，天生有免疫活性的胞壁肽（如胞壁酰二肽MDP），进而经过激活NOD2记号来增强免疫调节动机；③ 给模子小鼠口服弥补表达SagA的工程菌（如让底本没有能增强免疫调节的粪肠球菌以及益生菌表达SagA）或注射分解的MDP，均能增强ICI（也席卷anti-CTLA-4）的抗肿瘤疗效。
Enterococcus peptidoglycan remodeling promotes checkpoint inhibitor cancer immunotherapy
2021-08-27, doi: 10.1126/science.abc9113
Science：调控肠道符合性免疫的新体制
Science[IF:47.728]
① LRP1正在肠道CD11c+ 髓系细胞中高表达，是髓系细胞皮相的SAA受体；② 髓系细胞中，LRP1能高效贯串SAA-视黄醇复合体并介导其内吞，进而向导视黄醛脱氢酶表达以匆匆进视黄醇转化为视黄酸；③ 小鼠中，SAA以及LRP1介导了维生素A依附性的肠道符合性免疫（B以及T细胞的肠道归巢和IgA天生），并增强口服免疫后的肠道习染抵当力；④ 所以，肠上皮表达的SAA与维生素A代谢物视黄醇变成复合体，被LRP1贯串并内吞进肠道髓系细胞，匆匆进天生视黄酸，进而介导维生素A依附性的肠道符合性免疫。
Serum amyloid A delivers retinol to intestinal myeloid cells to promote adaptive immunity
2021-09-17, doi: 10.1126/science.abf9232
Science：前线腺癌内渗出调节退步？或是肠菌正在扰乱
Science[IF:47.728]
① 多种去势处置的小鼠模子都说明，肠道菌群的生存会匆匆进前线腺癌的掘起；② 严肃瘤胃球菌以及产酸拟杆菌昭著富集于处于去势抵当阶段的小鼠；③ 抗生素处置的去势小鼠中，血清中雄激素——脱氢表雄酮（DHEA）以及睾酮的浓度昭著下降；④ 严肃瘤胃球菌以及产酸拟杆菌可将孕烯醇酮以及羟孕烯酮转化为DHEA以及睾酮，进而作用肿瘤繁华；⑤ 人肠道中的一种瘤胃球菌（Ruminococcus sp. DSM_100440）也会到场雄激素的分解，且与较差的临床了局相干。
Commensal bacteria promote endocrine resistance in prostate cancer through androgen biosynthesis
2021-10-08, doi: 10.1126/science.abf8403
Science：IBD引发精神疾病？或是肠-脑血管轴平衡了
Science[IF:47.728]
① 肠道炎症导致肠血管屏蔽损害，使LPS等细菌产品移位入血，炎症向肝脏以及大脑等肠外器官仓卒散布，炎症细胞向这些器官凑集；② 大脑对于此做出反映，合拢脑脉络丛中的血管屏蔽（PVB，血-脑脊液屏蔽的一全体），进而制止大分子以及炎症细胞投入大脑；③ 体制上，LPS可调治PVB通透性，脑脉络丛正在肠道炎症后上调Wnt/β-catenin记号引起PVB合拢；④ 脉络丛内皮细胞封锁的模子小鼠生存近期记忆弊端以及焦躁样动作，说明PVB合拢可引起认知以及动作弊端。
Identification of a choroid plexus vascular barrier closing during intestinal inflammation
2021-10-22, doi: 10.1126/science.abc6108
胡泽汗等Science攻破：一种新式肠道抗菌蛋白，正在寄生虫习染时损坏肠屏蔽
Science[IF:47.728]
① SPRR2A是一种新式肠道抗菌蛋白，可正在肠道菌群向导下，经TLR-Myd88通路由潘氏细胞以及杯状细胞表达渗出；② SPRR2A经过损坏细菌膜，挑选性杀去世革兰氏阴性细菌；③ 分解其敲除小鼠说明，SPRR2A能塑造小肠菌群、限制革兰氏阴性菌正在小肠黏液层定植以及战斗肠上皮，损坏小鼠抵当革兰氏阴性肠道致病菌的习染；④ 肠道蠕虫习染时期，2型细胞因子IL-4以及IL-13经过STAT6向导SPRR2A高表达，进而抵当因蠕虫习染损坏肠屏蔽引起的细菌对于肠构造的入侵。
Small proline-rich protein 2A is a gut bactericidal protein deployed during helminth infection
2021-11-05, doi: 10.1126/science.abe6723
Science：高纤维饮食或有益免疫调节，益生菌存疑
Science[IF:47.728]
① 评估黑色素瘤患者的粪便菌群组成（n=293）、益生菌（n=158）以及膳食纤维（n=128）的摄取状况，及与ICB调节反应的联系；② 调节前利用益生菌与较差的PFS以及调节应对相干，但没有昭著；③ 膳食纤维摄取布满（≥20克/天）与较好的PFS以及调节应对相干（尤为纤维摄取布满且没有弥补益生菌者），纤维摄取每推广5克/天，疾病掘起或仙逝告急升高30%；④ 小鼠中，低纤维饲喂或弥补益生菌使肿瘤中的IFNγ阴性细胞毒性T细胞削减，升高抗PD-1调节动机。
Dietary fiber and probiotics influence the gut microbiome and melanoma immunotherapy response
2021-12-23, doi: 10.1126/science.aaz7015
Science：动物冬眠时没有吃没有喝若何保住肌肉量？肠道菌群正在帮助
Science[IF:47.728]
① 经过同位素符号、抗生素处置等方式，争论地松鼠肠道菌群介导的尿素氮轮回再运用对于宿主冬眠时期蛋白质稳态的奉献；② 相较于夏日，冬天（稀奇是晚冬）地松鼠肠道的尿素通道蛋白表达上升，匆匆进将血液尿素（源自宿主蛋白质分化代谢）转运至肠腔；③ 且菌群的尿素酶基因及其照顾菌（如Alistipes）品貌上升，匆匆进将肠腔的尿素转化为氨以及氨基酸等代谢物；④ 这些菌群代谢物被宿主接收，再转化为宿主的含氮代谢物以及蛋白质，完结氮的接收运用，维持宿主蛋白质稳态。
Nitrogen recycling via gut symbionts increases in ground squirrels over the hibernation season
01-27, doi: 10.1126/science.abh2950
Science：少吃点能改善免疫代谢，潜伏枢纽因子被锁定
Science[IF:47.728]
① 强健人中，延续2年约14%的热量限制（CR）可改善胸腺功能，克制胸腺减弱，推广胸腺的T细胞输出；② CR还引起了脂肪构造转录重编程，触及线粒体生物能、抗炎反应以及短命相干通路，但犹如未引起符合性生热以及脂肪构造褐化；③ CR克制了脂肪构造中的血小板活化因子乙酰水解酶PLA2G7基因表达（其高表达与多种代谢、心血管、免疫以及炎症疾病相干）；④ 小鼠中，敲除Pla2g7改善了高脂驯养下的代谢强健，削减了脆弱相干炎症以及NLRP3炎性体活化和胸腺没落。
Caloric restriction in humans reveals immunometabolic regulators of health span
02-11, doi: 10.1126/science.abg7292
Science：致病菌的锤炼给予肠道ILC3更强的抗习染才略
Science[IF:47.728]
① 小鼠永远习染肠道致病菌（鼠柠檬酸杆菌）后，可正在肠道中孕育一个“受训”的3型自然淋巴细胞（ILC3）亚群（Tr-ILC3）；② 当再次蒙受不异或分歧的致病菌时，Tr-ILC3能加紧增殖、增强IL-22天生，比“未受训”的ILC3有更强的掌握习染才略；③ Tr-ILC3能正在小鼠肠道中永恒生存（至多数月），且其天生以及功能没有依附于T细胞；④ RNA测序说明，首次蒙受致病菌使ILC3产生长久的代谢重塑，进而变成有更强的增殖以及IL-22天生才略的Tr-ILC3。
Trained ILC3 responses promote intestinal defense
02-24, doi: 10.1126/science.aaz8777
Science：肠菌分子投入大脑，调控食欲以及体温
Science[IF:47.728]
① 小鼠多个脑区（席卷调治食欲以及体温的下丘脑）都表达模式判别受体Nod2，其配体细菌胞壁肽能经过肠道入血并投入大脑；② 下丘脑GABA能神经元表达的Nod2，到场调控年长雌鼠的代谢，其敲除导致进食增加、体重增添、体温掌握改革；③ 胞壁肽投入大脑后，经过激活Nod2直接克制下丘脑弓状核GABA能神经元震动（与进食后的状况如同），进而削减食欲；④ 服用抗生素会损坏由Nod2介导的小鼠进食掌握，提醒肠道菌群是调控进食的Nod2配体起因。
Bacterial sensing via neuronal Nod2 regulates appetite and body temperature
04-14, doi: 10.1126/science.abj3986
Cell：绘制人体肠道发育的时空图谱
Cell[IF:41.582]
① 运用scRNA-seq以及空间转录组形容肠道的样式产生历程，审定上皮、间充质祖细胞群等101种细胞状态，和枢纽样式产生的里程碑事宜；② 形容了隐窝-绒毛轴行程的原理，神经、血管、间充质的样式产生和肠道发育中的免疫细胞群；③ 决定了发育中成纤维细胞以及肌成纤维细胞亚型的崩溃层次；④ 成纤维细胞正在干细胞、血管系统以及肠道相干淋巴构造拥有功能各类性；⑤ 构建样式梯度模子，形容细胞崩溃的秩序，决定少有的发育性肠道疾病相关的细胞以及位置。
Spatiotemporal analysis of human intestinal development at single-cell resolution
2021-01-05, doi: 10.1016/j.cell.2020.12.016
Cell：大肠癌细胞若何正在化疗中“夹缝求生”
Cell[IF:41.582]
① 利用患者的大肠癌移植瘤小鼠模子、细胞条形码以及数学建模等方式，争论化疗下的癌细胞耐药存在（DTP）；② 细胞条形码分解说明，DTP状态下的肿瘤仍保有克隆繁复性；③ 数学建模也支柱该“均等”模子，即肿瘤内的癌细胞拥有整齐的投入DTP状态进而耐受调节的才略；④ RNA测序说明，癌细胞的DTP状态一致于胚胎发育中的“滞育”状态，其细胞周期减缓、mTOR通路活性升高、自噬推广，进而增强癌细胞存在力，并能正在调节休止后脱节DTP，恢复肿瘤繁殖。
Colorectal Cancer Cells Enter a Diapause-like DTP State to Survive Chemotherapy
2021-01-07, doi: 10.1016/j.cell.2020.11.018
Cell：习染“锻炼”宿主，“进级”菌群对于病原体的抵当力
Cell[IF:41.582]
① 肠道菌群能抵挡致病菌正在宿主小鼠肠内定植；② 粪菌移植考察说明，习染过食源性病原菌假结核耶尔森菌的小鼠，其肠道菌群能损坏受体小鼠抵当之后的肺炎克雷伯菌的肠内定植；③ 体制上，习染向导宿主胆汁酸代谢改革，使肠内牛磺酸水平上升，进而推广了δ变形菌等运用牛磺酸的细菌，这些菌转化牛磺酸孕育的硫化物能克制病原体的需氧呼吸影响；④ 弥补牛磺酸可改革菌群并增强其定植抵当影响，而螯合硫化物的药物会作对菌群组成，匆匆进病原体入侵。
Infection trains the host for microbiota-enhanced resistance to pathogens
2021-01-15, doi: 10.1016/j.cell.2020.12.011
Cell：肠道真菌若何塑造抗真菌免疫？
Cell[IF:41.582]
① 强健人以及小鼠中，异常比率的肠道共生真菌（尤为是念珠菌属）能被血清中的抗真菌IgG判别，肠道中的白色念珠菌是这类抗体的主要向导者；② 小鼠考察说明，肠道的真菌定植能引起肠外（脾脏）淋巴构造生发焦点B细胞扩增，孕育的抗真菌IgG可抵当一般以至免疫克制状态下的多种念珠菌习染；③ 抗真菌IgG的天生依附于资质免疫调控因子CARD9以及CARD9+CX3CR1+巨噬细胞，正在侵害性念珠菌病患者中CARD9功能缺失性基因渐变与抗真菌IgG应对弊端相干。
Human gut mycobiota tune immunity via CARD9-dependent induction of anti-fungal IgG antibodies
2021-02-05, doi: 10.1016/j.cell.2021.01.016
Cell：迄今最大的人类肠道噬菌体基因组数据库
Cell[IF:41.582]
① 分解寰球28060集体肠道宏基因组以及2898个肠道细菌参照基因组，取得约14.2万集体肠道噬菌体基因组，建立肠道噬菌体数据库（GPD），审定出2.1万个病毒群（VC，近似于属水平），大大扩充了肠道噬菌体的各类性；② 噬菌体宿主分解再现，厚壁菌门细菌的噬菌体各类性最高，且约36%的VC有没有止一种细菌宿主；③ 肠道噬菌体组的类别与人糊口办法相干，审定出280个正在寰球精深散布的VC，席卷1个与p-crAssphage有如同性格的进化枝Gubaphage。
Massive expansion of human gut bacteriophage diversity
2021-02-18, doi: 10.1016/j.cell.2021.01.029
Cell：肠道蠕虫若何为神经病毒“翻开后门”？
Cell[IF:41.582]
① 与肠道蠕虫的共习染可加剧小鼠习染西尼罗河病毒（WNV，一种嗜神经性黄病毒）的疾病重要性，陪同肠神经以及核心神经系统的WNV数目推广；② 二者的共习染导致肠道样式以及肠上皮组织极度、肠道转运时光缩短、肠神经收集改革等肠道病理；③ 肠粘膜屏蔽的损害引起共生细菌移位入血至脾，进而毁伤了WNV尤其性的CD8+ T细胞应对；④ 这些表型与蠕虫习染相干的2型免疫相关：蠕虫习染经过活化虎魄酸-Tuft细胞-IL25-IL4R肠道回路，加剧小鼠的WNV习染。
Enteric helminth coinfection enhances host susceptibility to neurotropic flaviviruses via a tuft cell-IL-4 receptor signaling axis
2021-02-25, doi: 10.1016/j.cell.2021.01.051
Cell：宿主基因以及肠道菌群若何协力形成自闭症动作？
Cell[IF:41.582]
① 运用敲除Cntnap2基因的自闭症小鼠模子，争论宿主基因与肠道菌群对于动作的作用；② 不料发明：多动由宿主基因主导，外交闭塞则由肠道菌群介导；③ 弥补罗伊氏乳杆菌ATCC 6475或代谢产品四氢生物蝶呤（BH4），可改善外交闭塞而非多动；④ 阻断BH4分解通路，弥补罗伊氏乳杆菌没法改善小鼠外交闭塞；⑤ 弥补罗伊氏乳杆菌以及BH4可匆匆进小鼠脑部外交嘉奖体制介导的突触传播。
Dissecting the contribution of host genetics and the microbiome in complex behaviors
2021-03-10, doi: 10.1016/j.cell.2021.02.009
Cell：工业化加快了人肠道菌群中的基因转化
Cell[IF:41.582]
① 对于来自分歧水准的工业化以及非工业化地带的15集体群的>4000份肠道菌群施行教育、结合以及测序，个中席卷来自单个个别的富集菌株；② 发明上千个细菌种属间，基因水平转化（HGT）的比率以及目的分歧；③ 近多少代宿主的菌群中积存了HGT，并且HGT正在个别中产生的频次很高，且拥有异质性；④ 对于分歧的人群施行较为争论，工业化的糊口办法与较高的HGT比率相关，短期产生的HGT的功能与宿主的工业化水平相关
Elevated rates of horizontal gene transfer in the industrialized human microbiome
2021-03-31, doi: 10.1016/j.cell.2021.02.052
傅静远等Cell攻破：从菌群基因层面，深挖人肠道菌群“指纹”以及作用强健的体制
Cell[IF:41.582]
① 分解338人隔断4年的肠道菌群，发明菌群的物种组成、代谢通路以及基因组成生存特定的个别内改变以及永恒牢靠性，各类性较高的菌群有较高的牢靠性；② 分歧微生物物种的基因牢靠性有分裂，基于高个别尤其性以及牢靠性的微生物基因组成性格构建菌群“指纹”，正在2个部队中均能确切判别分歧菌群样本是否来自统一人；③ 审定出190个纵向的微生物-宿主表型有关以及519个微生物-血浆代谢物有关，主要触及心血管代谢性格、维生素B以及尿毒素，菌群可经过血浆代谢物作用宿主表型；④ 菌群的抗生素耐药性随时光推广，或与吃肉以及养殖业抗生素利用相关。
The long-term genetic stability and individual specificity of the human gut microbiome
2021-04-09, doi: 10.1016/j.cell.2021.03.024
Cell：胎儿体内的细菌及其正在早期免疫发育中的影响
Cell[IF:41.582]
① 孕中期人类胎儿构造器官中生存席卷效应记忆T细胞正在内的各类化的T细胞；② 用16S rRNA基因测序，正在胎儿肠道、皮肤、胎盘以及肺中检测到生物量低但分歧于阳性比照的细菌记号；③ 重新鲜胎儿构造中教育结合出多种活细菌，席卷测序检测到的葡萄球菌以及乳杆菌等菌属的细菌；④ 用扫描电镜以及RNA原位杂交方式，正在14周胎儿的肠腔内看到割裂地生存于黏蛋白样线状物中的球菌样组织以及真细菌RNA；⑤ 源自胎儿的结合菌能正在体外向导胎儿肠系膜淋勾串记忆T细胞的激活
Microbial exposure during early human development primes fetal immune cells
2021-06-01, doi: 10.1016/j.cell.2021.04.039
Cell：双比方杆菌对于生命早期免疫发育的努力作用
Cell[IF:41.582]
① 婴儿出身后生存有序的免疫谱改变纪律，如反映微生物定植的黏膜尤其性T细胞的扩增；② 肠道菌群中空洞双比方杆菌以及母乳寡糖（HMO）运用基因，与生命早期的系统性炎症以及免疫失衡相干；③ 弥补婴儿双比方杆菌EVC001（表达一切HMO运用基因），能削减母乳驯养婴儿的肠道炎症，升高肠道Th2以及Th17细胞因子并上调IFNβ；④ 这些婴儿的粪便悬液能使T细胞极化向Th1以及Treg竖直，粪便中富集的代谢物吲哚-3-乳酸或经过上调半乳凝素1表达来克制Th2以及Th17活化。
Bifidobacteria-mediated immune system imprinting early in life
2021-06-17, doi: 10.1016/j.cell.2021.05.030
Cell：高纤维或发酵食品的饮食干涉，若何作用菌群调治免疫？
Cell[IF:41.582]
① 36名受试者随机分2组，施行10周高纤维或发酵食物的饮食干涉，分解肠道菌群以及免疫谱的纵向改变；② 高纤维饮食未昭著改革菌群各类性，但推广了菌群密度及其编码的碳水化合物活性酶；③ 高纤维饮食干涉引起的免疫应对可分为3类，基线菌群α各类性与干涉引起的炎症记号物改变有负相干趋势（菌群各类性高则炎症水平升高，各类性低则炎症水平上升）；④ 发酵食物干涉昭著推广了菌群各类性、升高了炎症记号物水平；⑤ 饮食干涉下的菌群以及免疫纵向分解可露出二者的互作联系。
Gut-microbiota-targeted diets modulate human immune status
2021-07-12, doi: 10.1016/j.cell.2021.06.019
Cell：生物钟经过肠道菌群调控资质性免疫的日夜节律
Cell[IF:41.582]
① 小鼠的多种抗菌肽表达消失出日夜节律，但正在无菌小鼠中，抗菌肽表达升高且没有再消失节律性表达；② 体制上，分节丝状菌与肠道上皮的粘附消失出日夜节律，经过3型自然淋巴细胞（ILC3）孕育的IL-22，以启动上皮细胞的STAT3表达及活化的日夜节律，进而导致抗菌肽的节律性表达；③ 生物钟经过掌握小鼠的进食节律，以调控分节丝状菌的节律性上皮粘附；④ 抗菌肽的节律性表达导致小鼠对于鼠伤寒沙门氏菌习染的抗性消失出日夜节律。
The microbiota 后天3晚上coordinates diurnal rhythms in innate immunity with the circadian clock
2021-07-28, doi: 10.1016/j.cell.2021.07.001
Cell：ILC3平衡匆匆进大肠癌繁华以及免疫调节耐药
Cell[IF:41.582]
① 人以及小鼠的CRC肿瘤微境况中，ILC3产生改革，即数目削减、可塑性增强（向ILC1变化）、与T细胞间的平定呈现极度，这些改变与IBD中的一致；② 一般状况下ILC3以及T细胞间经过抗原呈递分子MHCII产生互作，塑造肠道菌群使其能向导1型免疫；③ 正在小鼠ILC3中尤其性敲除MHCII，会微小肠道1型免疫，匆匆进侵害性CRC的繁华并抵当抗PD-1免疫调节；④ IBD患者肠道菌群改革（尤为拟杆菌），将其菌群移植给小鼠会微小肠道1型免疫以及对于免疫调节的应对。
Dysregulation of ILC3s unleashes progression and immunotherapy resistance in colon cancer
2021-08-17, doi: 10.1016/j.cell.2021.07.029
Cell：人类大肠癌中的多细胞免疫核心
Cell[IF:41.582]
① 纳入28例能施行错配建设(MMRp)以及34例错配建设弊端(MMRd)患者，对于结直肠肿瘤以及临近一般构造的371223个细胞施行单细胞测序；② 审定出88个细胞亚群及其204个相干基因表达法式，肿瘤部位的单核细胞以及巨噬细胞被重塑，且正在MMRd肿瘤中表达更多的免疫激活法式；③ 决定了分歧细胞类别的表达法式，这些表达法式正在受作用个别的肿瘤中独特改变；④ 肿瘤-管腔界面生存骨髓细胞排斥焦点，及一个MMRd富集的免疫核心，由T细胞以及表达CXCR3配体的细胞组成。
Spatially organized multicellular immune hubs in human colorectal cancer
2021-08-27, doi: 10.1016/j.cell.2021.08.003
Cell：可打扫莱姆病且没有作对肠道菌群的窄谱抗生素
Cell[IF:41.582]
① 挑选452种放线菌提取物中抗伯氏疏螺旋体（BB，即莱姆病病原体）的物质，发明至多6种选个性克制物；② 个中吸水链霉菌孕育的潮霉素A活性最高，挑选性克制螺旋体繁殖席卷BB及梅毒螺旋体；③ 潮霉素A靶标核糖体，或可经过下调BB周质贯串蛋白BmpD转运系统完结挑选性抗菌；④ 经过分歧小鼠测验发明，潮霉素A可无效消除BB习染且没有形成昭著肠道菌群平衡；⑤ 但潮霉素A若何下调BmpD表达的体制尚没有认识，相干利用还处于临床前期，需审慎周旋。
A selective antibiotic for Lyme disease
2021-10-06, doi: 10.1016/j.cell.2021.09.011
Cell：菌群调控抗肿瘤免疫的新体制
Cell[IF:41.582]
① 菌群记号编程肿瘤微境况（TME）中的单核吞噬细胞，空洞菌群使小鼠TME中匆匆肿瘤巨噬细胞增加、抗肿瘤的单核细胞以及树突细胞削减；② 体制上，菌群孕育的STING振奋剂c-di-AMP能向导瘤内单核细胞孕育IFN-I，进而调控巨噬细胞极化、匆匆进NK细胞与树突细胞互作，增强抗肿瘤免疫；③ 用高纤维饮食调治菌群（推广产c-di-AMP的Akk菌）能触发该体制，增强免疫反省点阻断（ICB）调节；④ 正在黑色素瘤患者中验证了TME免疫性格与ICB应对的联系，移植应对者粪菌能向导小鼠瘤内IFN-I，重塑TME，改善ICB疗效。
Microbiota triggers STING-type I IFN-dependent monocyte reprogramming of the tumor microenvironment
2021-10-07, doi: 10.1016/j.cell.2021.09.019
Cell：肠道习染履历若何损坏肠神经？
Cell[IF:41.582]
① 肠道的细菌或线虫习染，可让小鼠肠肌层巨噬细胞（MM）取得构造损坏表型、上调Arg1，正在之后习染其他病原时避让肠神经细胞丢掉以及肠道静止闭塞、维持能量平定；② 常战斗病原的宠物店小鼠也抵当习染导致的肠神经丢掉；③ 细菌向导的神经损坏影响依附于肠交感神经活化以及MM的β2AR记号；④ 线虫引起的损坏影响没有限度于习染肠段，其向导Th2应对、匆匆进卑劣的嗜酸性粒细胞孕育IL-4以及IL-13，以向导MM表达Arg1，习染后的骨髓以及构造境况维持长效损坏。
Enteric pathogens induce tissue tolerance and prevent neuronal loss from subsequent infections
2021-10-29, doi: 10.1016/j.cell.2021.10.004
Cell：大脑能“记着”肚子里的炎症
Cell[IF:41.582]
① 正在震动依附性细胞符号小鼠模子中，DSS向导的结肠炎以及酵母聚糖向导的腹膜炎均可以激活大脑岛叶皮层（InsCtx）中的一群神经元；② 经过化学遗传学目的从新激活这群神经元，恐怕重现结肠以及腹膜的炎症反应状态，所以这些神经元能“储藏”并“读取”外周炎症的免疫反应记忆；③ InsCtx神经元经过自主神经系统与结肠以及腹膜相接；④ 克制InsCtx神经元活化，可加重DSS向导的结肠炎时期的炎症反应。
Insular cortex neurons encode and retrieve specific immune responses
2021-11-08, doi: 10.1016/j.cell.2021.10.013
Cell：“偏食”介导了自闭症与肠道菌群的有关
Cell[IF:41.582]
① 纳入自闭症（ASD）患儿99例、未沾病同胞51例、无血统联系的比照孩子97例，分解粪便宏基因组以及其他表型/临床数据；② 菌群与ASD之间的直接有关很有限，菌群目标对于ASD诊疗的注释度极低，Romboutsia timonensis是仅有与ASD诊疗相干的细菌（正在患儿中削减）；③ 相反，菌群与春秋、饮食以及粪便质量出色相干；④ 饮食介导了ASD与菌群的有关：ASD表型（如趣味狭窄）与饮食各类性升高相干，这种饮食偏好反过来与菌群α各类性升高以及粪便质量较稀奇关。
Autism-related dietary preferences mediate autism-gut microbiome associations
2021-11-11, doi: 10.1016/j.cell.2021.10.015
Cell：维持肠道稳态的Th17若何“摇身一变”匆匆脑炎？
Cell[IF:41.582]
① 分解小鼠正在稳态下以及核心神经系统（CNS）自身免疫炎症EAE时期多个构造的Th17细胞的异质性、可塑性以及迁徙状况；② Th17细胞消失构造尤其性性格以及构造内异质性；③ 正在EAE小鼠脾脏中审定出2类Th17细胞，不同是稳态相干的SLAMF6+干细胞样Th17（精深生存于分歧构造中，正在肠道中受菌群维持）以及可尤其性迁徙至CNS的致脑炎CXCR6+ Th17；④ 肠道的TCF1+ SLAMF6+干细胞样Th17可被IL-23向导孕育致脑炎的GM-CSF+ IFN-γ+ CXCR6+ T细胞。
Stem-like intestinal Th17 cells give rise to pathogenic effector T cells during autoimmunity
2021-12-06, doi: 10.1016/j.cell.2021.11.018
Cell：两种人类结直肠息肉的分歧癌变之路
Cell[IF:41.582]
① 对于两种最常见的人类结直肠息肉——通例腺瘤以及锯齿状息肉，和配对于孕育的结直肠癌施行单细胞转录组学以及成像图谱分解；② 腺瘤本原于WNT启动的干细胞扩增，而锯齿状息肉本原于经过胃化生崩溃的细胞；③ 正在产生高渐变以前，化生相干损害与细胞毒性免疫微境况相耦合，肿瘤细胞取得干性则作用抗原呈递，进而作用符合性免疫微境况；④ 微卫星没有牢靠的CRC蕴含分歧的非化生区域，正在这边肿瘤细胞取得干细胞个性，而细胞毒性免疫细胞被消费。
Differential pre-malignant programs and microenvironment chart distinct paths to malignancy in human colorectal polyps
2021-12-14, doi: 10.1016/j.cell.2021.11.031
Cell：GSDMB调控肠上皮建设
Cell[IF:41.582]
① 炎症性肠病（IBD）患者中，GSDMB正在发炎肠黏膜中表达上升，单细胞测序分解说明其表达主要富集于（隐窝顶部）结肠上皮细胞；② 体外测验以及转录组学分解说明，GSDMB匆匆进肠上皮建设，该影响没有依附于细胞焦亡，而是与匆匆进细胞增殖以及迁徙相关；③ 正在GSDMB-/-细胞中，PDGF-A介导的FAK（黏着斑激酶）磷酸化被克制，推广了黏着斑变成，进而制止上皮损害处的细胞迁徙以及伤口愈合；④ 表达GSDMB的IBD相干SNPs，可削减肠上皮细胞的增殖以及迁徙、推广黏附。
GSDMB is increased in IBD and regulates epithelial restitution/repair independent of pyroptosis
01-11, doi: 10.1016/j.cell.2021.12.024
郭春君团队Cell攻破：正在繁复菌群中露出单个肠菌基因功能，新方式来了
Cell[IF:41.582]
① 开垦一套对于5个菌门的非模式肠道细菌施行基因安排的高通量过程；② 经过多因子优化，决定了对于梭菌纲38个非模式菌株施行基因转化的方式，对于个中28个菌株建立了基于CRISPRi或II类内含子的基因编写器械；③ 该方式能无效施行细菌基因编写，并正在体外以及小鼠体内调治对于应的细菌代谢产品（如SCFA）；④ 构建敲除baiH（胆汁酸7α脱羧通路的枢纽基因）的某梭菌菌株，将该渐变株或比照菌株定植到有繁复菌群的小鼠中施行对于比分解，说明敲除baiH作用了宿主的胆汁酸池以及菌群组成，并经过削减丹毒丝菌科的扩展加重结束肠炎症。
Genetic manipulation of gut microbes enables single-gene interrogation in a complex microbiome
01-19, doi: 10.1016/j.cell.2021.12.035
Cell：饮食以及菌群代谢物若何作用肠菌？从糖以及丁酸的互作窥视冰山一角
Cell[IF:41.582]
① 丁酸可克制拟杆菌目细菌繁殖，该影响有菌种/株分裂，并因分歧类别的碳源（糖）而异；② 拟杆菌对于丁酸的敏锐/抵当性与其酰基辅酶A代谢相关：酰基辅酶A转化酶可将丁酸转化为潜伏有毒代谢物丁酰辅酶A，而酰基辅酶A硫酯酶可削减丁酰辅酶A的积存；③ 酰基辅酶A硫酯酶的基因功能分裂以及酰基辅酶A转化酶的表达调控（煽动子SNP）分裂，作用拟杆菌对于丁酸的提防；④ 拟杆菌属正在人肠道中的品貌，与酰基辅酶A转化酶表达以及丁酸水平的独特影响相干。
Strain-level fitness in the gut microbiome is an emergent property of glycans and a single metabolite
02-03, doi: 10.1016/j.cell.2022.01.002
粟硕+施莽等Cell攻破：野味动物的病毒组性格，及其与人类疾病的出色联系
Cell[IF:41.582]
① 用高通量宏转录组学方式，分解中国20省分的1941只野味动物（5个目、18个种）的病毒组；② 审定出102种能习染哺乳动物的病毒（揭开13个病毒科），65种是新病毒；③ 21种病毒是对于人以及六畜有潜伏高告急的病毒，果子狸照顾“高危”病毒数目至多；④ 一些病毒可正在野灵便物以及野味动物间跨物种传播，假设子狸中能检测到蝙蝠冠状病毒HKU8；⑤ 还检测到多种习染人类的病毒，受习染的动物有些有病症、有些无病症，需警觉人以及野味动物间的双向病毒传播。
Virome characterization of game animals in China reveals a spectrum of emerging pathogens
02-15, doi: 10.1016/j.cell.2022.02.014
Cell：黏膜真菌损坏肠道屏蔽，并匆匆进外交动作
Cell[IF:41.582]
① 正在人以及小鼠的肠道中，都可审定出一群黏膜相干真菌，与肠腔真菌的组成有昭著分裂；② 一定黏膜相干真菌（而非肠腔真菌）的肠道定殖可向导CD4+ Th细胞孕育IL-22，上调JAK/STAT记号，匆匆进DNA建设，并增强小鼠的肠道屏蔽功能；③ 黏膜相干真菌可正在DSS+抗生素或鼠柠檬酸杆菌习染向导的小鼠肠道损害中起损坏性影响；④ 其它，一定黏膜相干真菌的肠道定殖可向导系统性的IL-17A孕育，并经过影响于神经元上的IL-17R，进而匆匆进小鼠的外交动作。
Mucosal fungi promote gut barrier function and social behavior via Type 17 immunity
02-16, doi: 10.1016/j.cell.2022.01.017
Cell：肠球菌中的强效细胞毒素
Cell[IF:41.582]
① 从寰球的屎/粪/海氏肠球菌结合株中，审定出一个肠球菌属成孔毒素家族（Epx）；② 组织争论再现，Epx是小β桶成孔毒素的一个分支，以β桶为顶部组织域，变成同源八聚体孔；③ 全基因组CRISPR-Cas9挑选发明，MHC/HLA-I是Epx2/3的受体，Epx可贯串人HLA-I和马、牛以及猪（而非小鼠）的MHC-I；④ 显露于匆匆HLA/MHC-I表达的IFN-γ，使人细胞系以及肠道类器官对于Epx的毒性变得敏锐；⑤ Epx2+ 屎肠球菌菌株经过Epx2的毒性，损害人免疫细胞（PBMC）以及肠道类器官。
Emerging enterococcus pore-forming toxins with MHC/HLA-I as receptors
03-07, doi: 10.1016/j.cell.2022.02.002
西湖大学Cell攻破：超毒力艰苦梭菌毒素若何伤肠道？锁定枢纽受体
Cell[IF:41.582]
① 用CRISPR挑选等方式，决定TFPI是超毒力分支艰苦梭菌表达的毒力因子TcdB2以及TcdB4的受体；② 用冷冻电镜剖析TcdB4-TFPI复合物的组织，并发明TcdB受体贯串区的残基变异将TcdB划分为2类，不同判别FZD（TcdB1/3/5）以及TFPI（TcdB2/4）；③ 敲除Tfpiβ（TFPI的一种同源异构体）使小鼠抵当TcdB4的毒性；④ TFPI正在肠隐窝高表达，用重组蛋白同时阻断TcdB2/4与TFPI以及CSPG4（肠上皮下细胞的TcdB受体）的贯串，可无效中以及其毒性、制止对于结肠上皮的损害。
TFPI is a colonic crypt receptor for TcdB from hypervirulent clade 2 C. difficile
03-17, doi: 10.1016/j.cell.2022.02.010
Cell：黏蛋白唾液酸化增强肠道黏液屏蔽，匆匆进与菌群折衷共生
Cell[IF:41.582]
① ST6唾液酸转化酶正在结肠杯状细胞高表达，并可被微生物病原相干分子模式向导；② ST6对于黏蛋白MUC2的唾液酸化可妨碍细菌降解黏蛋白，维持肠道黏液屏蔽齐全性；③ 正在小儿IBD患者中审定出使ST6酶活受损的ST6基因变异；④ 引入患者的ST6变异使小鼠肠道黏液变薄、菌群入侵推广，对于结肠炎更易感；⑤ 并引起肠道菌群平衡，适量的丁酸积存克制了肠干细胞增殖以及肠上皮建设；⑥ 口服一般黏蛋白或用Foxo3（介导丁酸对于肠干细胞的克制影响）克制剂调节，可改善St6弊端小鼠的结肠炎。
Mucus sialylation determines intestinal host-commensal homeostasis
03-17, doi: 10.1016/j.cell.2022.02.013
Cell：分解生物学方式新攻破，助力开采微生物组代谢物
Cell[IF:41.582]
① 开垦一种基于算计-测验的分解生物学方式，用于审定以及表征生物分解通路；② 主要方法席卷：算计机审定生物分解基因簇→算计机协助妄图正在细菌以及真核微生物中都能表达的分解遗传元件→转入到各类化的微生物中→审定对于应的代谢物→分解其组织以及功能；③ 用该方式从人体共生菌惰性乳杆菌中发明了一类核苷酸代谢物tyrocitabine，对于这类代谢物及其分解通路的分解说明其有原酸酯-磷酸盐组织，能克制蛋白质翻译，且tRNA分解酶到场了其生物分解。
Cross-kingdom expression of synthetic genetic elements promotes discovery of metabolites in the human microbiome
04-01, doi: 10.1016/j.cell.2022.03.008
起因： 关切肠小火伴们 关切肠
聚群英，匆匆调换
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